Наряду с этими трудами Ориген посвящал свое перо изъяснению глубочайших основ христианской догматики. Его знаменитая книга «О началах» (Περι ’αρχων) представляет первый в церковно-христианской литературе опыт пространного богословского трактата, раскрывающего основные понятия о Божестве и мироздании в стройном синтезе. Именно в этой книге Ориген излагал учение о Сыне Божьем — Единосущном и Единородном Логосе — в законченных формулах, призванных вытеснить из христианской догматики идеи монархианства. Автор книги «О началах» мог по праву занять первое место среди христианских богословов, но некоторые идеи, выраженные в его книге, вызвали неодобрение и послужили поводом к осуждению великого учителя. Эти догматические споры возгорелись позже, в конце жизни Оригена, но еще до того, вскоре после появления книги Περι ’αρχων, его положение в Александрии было поколеблено конфликтом с епископом Димитрием, уже давно таившим раздражение по поводу громкой славы Оригена. Поводом к разрыву послужило то обстоятельство, что епископы Иерусалимский и Кесарийский, искренно почитавшие Оригена, в бытность его в Палестине (ок. 230 г.) посвятили его в иерейский сан, и Димитрий заявил протест против посвящения скопца, притом в чужой епархии. Примечательно, что во время разгоревшегося спора не было упомянуто о каких-либо еретических воззрениях Оригена, и протест Димитрия касался лишь формальной стороны дела. Как бы то ни было, Оригену пришлось покинуть Александрию, где заместителем его во главе огласительного училища был его ученик Геракл, а с возведением последнего на александрийскую кафедру (после смерти Димитрия, ок. 232 г.) — другой ученик его, Дионисий (впоследствии тоже епископ Александрийский, с 247 по 264 г.). Ориген удалился в Кесарию Палестинскую и здесь продолжал свою неутомимую деятельность; сюда также стекались к нему отовсюду ученики, среди которых был Григорий, впоследствии знаменитый епископ Неокесарийский и чудотворец; здесь Ориген закончил свое издание «Гекзаплов» и написал целый рад трактатов по всем вопросам, волновавшим христианское сознание. Одним из последних его капитальных трудов было «Опровержение Цельса» — языческого философа, написавшего в 70-е гг. II века книгу против христиан, под заглавием «Истинное слово» (Λογος ’αληθης); отповедь на эту книгу была составлена Оригеном в конце 40-х гг. III века, по просьбе верного друга и мецената его Амвросия, вообще игравшего роль неизменного вдохновителя Оригена и побуждавшего его писать без отдыха. Объемистая книга Κατα Κελσου (в 8 частях) является одним из замечательнейших трудов Оригена и принадлежит к числу драгоценнейших памятников христианской литературы по обилию рассыпанных в ней указаний на все течения христианской мысли: мы уже имели случай заметить, как часто приходится ссылаться на эту книгу при изучении гностических идей. Кроме того, личность самого автора книги здесь обрисовывается во всем блеске могучего таланта и полемической добросовестности: опровергая Цельса, Ориген нигде не пытается исказить его слова или его доводы и с удивительной беспристрастностью цитирует все его едкие обличения грубости библейского текста, все его указания на несообразность евангельских повествований, на ничтожность и бесцельность приписываемых Иисусу Христу чудес, на невозможность признания Божественным Того, Чье сошествие на землю прошло незамеченным, и т. п. Цельс употреблял в своей полемике то оружие насмешки и тупого глумления, которым впоследствии пользовались Вольтер и все убежденные враги христианства до наших дней; Ориген опровергал его с обычной силой и талантом, отстаивая немеркнущие в человеческой душе религиозные идеалы. К сожалению, мы не можем остановиться здесь на рассмотрении этой интереснейшей книги. Нет возможности здесь заняться и разбором других трудов великого Александрийца. Мы не будем упоминать и о всех превратностях его жизненной судьбы, о скитаниях его среди своих ненавистников и почитателей. Эта бурная, доблестная жизнь увенчалась наконец славой мученичества: в 250–251 г., во время гонения при Деции, Ориген был схвачен, подвергнут пыткам и тяжкому заключению, но никакие страдания не могли заставить старого борца за истину отречься от Христа. Угрозы лютой казни почему-то не были приведены в исполнение: Ориген пережил гонение и был освобожден из темницы; дух его остался несокрушимым, но физические силы были надломлены. В 254 г., в Тире, великий светоч христианской мысли угас.