Молодой император возненавидел Англию как бич своей жизни и главное препятствие на пути к своей мечте; он называл ее «отвратительным Альбионом» и порицал британское золото как главный источник бед Франции. Днем и ночью, на фоне сотни других проектов, он планировал строительство военного флота, который должен был покончить с владычеством Британии на морях. Он вливал средства и рабочих в военно-морские арсеналы Тулона и Бреста, испытывал дюжину капитанов, чтобы найти адмирала, который смог бы привести растущий французский флот к победе. Он думал, что нашел такого человека в лице Луи де Ла Туш-Тревиля, и стремился вдохновить его видением Британии, которая будет захвачена и побеждена. «Если мы сможем стать хозяевами Ла-Манша на шесть часов, мы станем хозяевами всего мира».13 Но Ла Туш-Тревиль умер в 1804 году, и Наполеон совершил ошибку, передав командование французским флотом Пьеру де Вильневу.
Вилленев не справился со своей ролью в египетском фиаско и проявил признаки неподчинения и робости. Он не верил в возможность захвата контроля над Ла-Маншем в течение шести часов и задерживался в Париже, пока Наполеон не приказал ему отправиться на свой пост в Тулон. Его инструкции были тонкими и сложными: вывести свой флот в море, позволить Нельсону преследовать его с главной британской флотилией, увлечь его через Атлантику в Вест-Индию, ускользнуть от него среди этих островов и как можно быстрее вернуться в Ла-Манш, где французские, голландские и испанские эскадры присоединятся к нему и вступят в бой с британскими судами там достаточно долго, чтобы позволить французской армии в тысячу лодок перейти в Англию, прежде чем Нельсон сможет вернуться из Карибского бассейна. Первую часть своей задачи Вильнев выполнил успешно: он заманил Нельсона в Америку, сбежал от него и поспешил вернуться в Европу. Но, добравшись до Испании, он решил, что его корабли и люди не в состоянии одолеть британских стражей Ла-Манша; вместо этого он попросил защиты у дружественной гавани в Кадисе. Наполеон, разочаровавшись в своем плане, отправил Вильневу приказ разыскать флот Нельсона и рискнуть всем в отчаянном противостоянии британскому контролю над морями.
Затем, в порыве решимости, император отвернул от Ла-Манша и развернул стотысячную армию для похода на юг и восток, к Рейну и дальше. Вся Франция с тревогой следила за ходом этой Великой армии, названной так Наполеоном, и каждый город на ее маршруте желал ей удачи в этом предприятии. Почти в каждой церкви священнослужители призывали молодежь нации подчиниться призыву к цветам; они доказывали на основании Священного Писания, что Наполеон теперь находится под непосредственным руководством и защитой Бога;14 Так скоро Конкордат принес свои плоды. Наполеон пошел на сотрудничество и распорядился предоставить двадцать тысяч карет по всему маршруту, чтобы поторопить и облегчить солдат во время их перехода через Францию.15 Он сам поехал в Страсбург вместе с Жозефиной, которая теперь была вся в тревоге и преданности; ее судьба тоже зависела от каждого броска костей. Он пообещал, что через несколько недель станет хозяином Вены.16 В Страсбурге он оставил ее на попечение Ремюза и поспешил на фронт.
Его стратегия, как обычно, заключалась в разделении и завоевании: не дать австрийским армиям объединиться, уничтожить или обездвижить вооруженные силы Австрии до прибытия русской орды, чьей помощи они ожидали; а затем одержать победу над русскими, которая вынудила бы его континентальных врагов заключить хотя бы временный мир. Несмотря на мрачные дни и темные ночи с дождем, грязью и снегом, Рейнская армия выполнила свою часть кампании с тщательностью и оперативностью, которые могут служить иллюстрацией того, насколько Наполеон был обязан своим маршалам. После недельных маневров 50 000 человек генерала Мака оказались под Ульмом, с трех сторон окруженные артиллерией, кавалерией и пехотой Даву, Сульта, Мюрата и Нея, и лишенные возможности отступить из-за ширины Дуная за их спиной. Осажденные австрийцы, испытывая голод, не имея продовольствия и боеприпасов, угрожали мятежом, если им не разрешат сдаться. Мак наконец сделал это (17 октября 1805 года); 30 000 его солдат были взяты в плен и отправлены во Францию. Это была одна из самых малозатратных и самых основательных и эффективных побед в истории войны. Император Франциск II и некоторые выжившие австрийцы из Ульма бежали на север, чтобы присоединиться к наступающим русским, а Наполеон вошел в Вену (12 ноября) без сопротивления и без демонстрации.