Эпидемия ВИЧ уникальна. В отличие от кори или оспы, вызывающих острые заболевания с последующим развитием иммунитета или смертью, ВИЧ встраивает свой вирусный материал (геном) в клетки хозяина, где инфекция сохраняется без немедленного эффекта. Вследствие этого ВИЧ-инфекция чаще всего прогрессирует очень медленно по сравнению с быстрой инфекцией кори, оспы, желтой лихорадки, полиомиелита и геморрагических вирусов. Поскольку люди продолжают быть инфицированными ВИЧ в течение многих лет, каждый носитель имеет много возможностей для передачи заболевания. В связи с теперешним увеличением продолжительности жизни ВИЧ-инфицированных людей вследствие противовирусного медикаментозного лечения возрастает риск для тех, кто не получает терапию, или носителей вируса, не осведомленных о своем статусе. Кстати, ВИЧ передается плохо; по оценкам, инфекция развивается менее, чем у 5 % контактировавших с вирусом людей. Для сравнения, вирусы кори и оспы заражают более 90 % восприимчивых людей. Однако одно сходство между ВИЧ и вирусом кори состоит в том, что оба вируса атакуют и заражают клетки иммунной системы. Результатом является иммуносупрессия, отдающая жертву на произвол других инфекционных заболеваний – ситуация, называемая оппортунистической инфекцией. Тем не менее в случае вируса кори иммунная система зараженного обычно преодолевает инфекцию и очищает организм от вируса. Исключения редки; только у от 1 из 100 000 до 1 из 1 000 000 человек, инфицированных вирусом кори, развивается сопутствующее хроническое заболевание, называемое подострым склерозирующим панэнцефалитом. Напротив, ВИЧ после заражения безжалостен. Вирус сохраняется на протяжении всей жизни его жертвы, даже у тех, кто получает соответствующую антиретровирусную терапию.
ВИЧ встраивает свой вирусный материал (геном) в генетический материал хозяина, тем самым позволяя инфекции сохраняться. ВИЧ-инфекция затем запускает каскад событий, распространяющих вирусы по нескольким лимфоидным тканям. Иммунный ответ, генерируемый против ВИЧ, эффективно снижает вирусную нагрузку хозяина, но не ликвидирует ее полностью. Остающиеся вирусы прячутся и вызывают слабовыраженную персистирующую инфекцию. По мере размножения персистирующих вирусов, их потомки оказываются в ловушке и/или заражают различные лимфоидные органы, вызывая хроническую активацию клеток иммунной системы и секрецию продуктов (цитокинов), вырабатываемых лимфоцитами и макрофагами. Цитокины активируют другие лимфоидные клетки, обеспечивая дальнейшую репликацию вируса, пока окончательное разрушение лимфоидных тканей не приведет к СПИДу – разрушению иммунной системы. Как вирус сам по себе, так и вирус в сочетании с противовирусным иммунным ответом (иммунопатология) считаются ответственными за повреждение лимфоидных клеток и тканей. Быстро, всего через несколько дней после первоначального заражения, происходит массовое вовлечение