Тем временем Мурзуфл продолжал дискредитировать Алексея IV. Доведя до сведения правителя информацию о мятежных настроениях его подданных, он ловко навел его на мысль, что крестоносцы являются единственными людьми, на которых можно положиться; следует заключить перемирие и ввести во Влахернский дворец франкские войска для защиты Алексея от его соперника в Святой Софии. Испуганный император поспешил согласиться с планом Мурзуфла, а сам его автор должен был стать посланником в лагерь в Эстаноре. Крестоносцы, видимо, приняли такое предложение; но этот план не был задуман для достижения успеха. Раскрыв его аритократам, Мурзуфл укрепил их враждебное отношение к Алексею IV, и они объединились и согласились на его план разделаться с императором.
Очевидно, в ночь на 28 января 1204 г. – даты трудно определять – Мурзуфл использовал свое официальное положение для входа во дворец, в котором евнух-казначей уже подкупил варягов. Разбудив Алексея, он заявил, что рядом враги, которые обвиняют императора в симпатии к латинянам и его зависимости от них. Алексей в ужасе стал молить о помощи. Готовый оказать услугу, Мурзуфл закутал императора в тяжелые одежды, вышел вместе с ним из дворца через боковой выход и привел его сначала в какую-то палатку в городе, а затем в мрачную тюрьму.
Приблизительно 5 февраля 1204 г. Мурзуфл был провозглашен императором под именем Алексея V. Его ближайшей задачей было избавиться от соперников. Исаак Ангел, в то время уже очень нездоровый, очевидно, умер естественной смертью прибризительно в это время. Дважды новый император пытался отравить молодого Алексея Ангела, которому удавалось избежать этой участи. В конечном счете, вероятно, в начале февраля Алексей V убрал его со своего пути: тот был задушен тетивой от лука. В Святой Софии все еще оставался Николай Канабос. У Мурзуфла уже были приверженцы среди простого народа, откуда Канабос получал свою главную поддержку; но простолюдины лицемерно обещали своему кандидату поддержку днем и исчезали ночью. Алексей V с легкостью схватил несчастного молодого человека и бросил его в тюрьму; его судьба неизвестна, но, скорее всего, он умер под заботливым присмотром императора.
Трудно судить о характере и способностях Алексея V Дуки Мурзуфла, так как все свидетельства исходят от его противников. Он добрался до трона как глава фракции, оппозиционной к крестоносцам и латинскому влиянию в империи; и это этноцентрическое отношение нашло широкий отклик в столице и приверженцев среди аристократии. Сам Мурзуфл был совершенно беспринципным; Никита Хониат обвиняет его еще и в распутстве. Тем не менее его действия наводят на мысль, что в сложившейся ситуации он знал, что нужно делать.
Алексей V принял некоторые конструктивные меры. Обнаружив, что имперская казна пуста, он обратился к целой армии людей, поднятых Ангелами до таких титулов, как севастократор и кесарь: каждого из них он заставил хорошо заплатить за то, чтобы они могли сохранить за собой свое высокое социальное положение и свою безопасность. Вдобавок были введены некоторые изменения в высшие должности. Никита Хониат, который был назначен логофетом бюро (великим логофетом) Алексеем III и сохранил свою должность при Алексее IV, теперь был ее лишен; на его место Алексей V посадил своего родственника со стороны жены Филокала. Никита, разумеется, считает это назначение плохим и утверждает, что у Филокала было больше честолюбия, чем компетентности; на самом деле ничто не указывает на то, что логофет когда-либо был на государственной службе. Помимо этих мер, о которых сообщает Никита, мы не знаем больше ничего о политической программе Мурзуфла.
Узурпатор попытался как можно дольше скрывать от крестоносцев факт свержения Алексея IV. От имени Алексея он отправил послание руководителям крестового похода, в котором просил их прибыть в город для ведения переговоров о мире. Только осторожность дожа Дандоло удержала баронов от попадания в ловушку. Пока шли обсуждения, слух о свержении Алексея IV достиг крестоносцев; по словам Робера де Клари, записка с сообщением об этом прилетела со стрелой, выпущенной в лагерь. Тогда дож продиктовал ответ новому правителю, советуя ему вернуть Алексея IV на трон, и пообещал ходатайствовать о сохранении его жизни перед законным императором. По одной версии, именно это письмо подсказало Алексею V убрать соперника со своего пути, хотя они в тот день обедали вдвоем. Тогда император потребовал, чтобы крестоносцы покинули его земли раз и навсегда; если он обнаружит их на своей территории через неделю, по его словам, он сметет их с лица земли. Они ответили с вызовом, что не хотят иметь дело с субъектом, который убил своего законного владыку и узурпировал его место.