По утверждению руководства ВМФ, а также Минобороны, приоритетным направлением в строительстве подводных сил является скорейший ввод в строй стратегических ракетоносцев проекта 995 «Борей» и лодок проекта 855 «Ясень». Но, несмотря на то, что финансирование этих проектов идет бесперебойно, основу подводных сил российского ВМФ, как и прежде, составляют стратегические ракетоносцы проектов 667 БДР и БДРМ, а также многоцелевые подводные лодки проектов 971 и 671 РТМ (последние постепенно выводятся из состава флота). История с доводкой и принятием на вооружение новых подлодок показывает, что в ближайшее время вряд ли стоит рассчитывать на полную модернизацию данной составляющей наших стратегических ядерных сил (СЯС). Поэтому решение о модернизации и возвращении в строй подводных лодок проектов 945 и 945А (с корпусом из титана) является абсолютно верным. Хотя надо признать, что модернизированные «Барракуды» и «Кондоры» все же не смогут полностью заменить лодки проекта 855.
В то же время началась программа активного перевооружения подводных сил новыми ракетными комплексами «Калибр» с крылатыми ракетами. После модернизации ими будут вооружены подводные лодки проекта 971, а так же модернизированные 945. Это, несомненно, повысит боевой потенциал наших подводных сил, дав им возможность поражать высокоточным оружием наземные цели. Однако сейчас ракеты комплекса «Калибр» имеют дальность всего в 200–500 километров, поэтому вряд ли они станут российскими «Томагавками». Несмотря на обещания, до сих пор так и не доведены до серийного производства сверхзвуковые крылатые ракеты с дальностью в 1500–2000 километров. Когда они появятся в нашем арсенале, пока неясно, хотя еще в 2012 году, подводя итоги учений на Каспии, главком ВМФ утверждал, что эти ракеты уже приняты на вооружение.
Как уже отмечалось выше, сегодня основу стратегических сил флота составляют лодки проектов 667 БДР и БДРМ. Проблемы с их заменой уже привели к тому, что было принято решение о передаче «Юрия Долгорукого» вместо Северного флота Тихоокеанскому. Хотя в целом решение о разделении «Бореев» после передачи всех восьми заказанных лодок по четыре на каждый флот, осталось без изменений. В то же время, БДРМ-ы Северного флота сейчас в достаточно хорошем состоянии, пройдя средний ремонт и модернизацию, в ходе которых они были перевооружены ракетами Р-29РМУ-2 «Синева». Сейчас в составе Северного флота находится шесть лодок этого проекта.
Проект 995 «Борей» с ракетным комплексом «Булава» сейчас является наиболее дорогостоящим проектом российского ВМФ. По предварительной оценке, его стоимость составляет до 60 % от выделенных всему флоту средств. С чем связана такая высокая стоимость при относительно низкой технической готовности всего проекта? Во многом это определяется необходимостью доводки новой автоматизированной системы управления стратегическими силами, о которой уже было написано выше. В целом, с учетом перевооружения БДРМ и их модернизации, возможно, стоило бы отказаться от постройки половины «Бореев», что помогло бы направить сэкономленные средства на реализацию других программ ВМФ.
Также не совсем понятно, во сколько обойдется строительство недавно заложенной лодки «Казань» проекта 855 «Ясень-М». Ее предшественницу, АПЛ «Северодвинск», до сих пор не передали флоту. По предварительным расчетам, стоимость «Казани», скорее всего, превысит 100 миллиардов рублей. В принципе, необходимо провести ревизию данного проекта – например, как вараинт: достроить «Казань», а в дальнейшем перейти к оптимизированному проекту, стоимость которого будет составлять примерно 30–40 млрд. рублей за корпус.
Также в состав подводных сил ВМФ России входят дизельные подводные лодки проектов 636/877 известные под общим названием «Варшавянка». Сейчас эти лодки также проходят модернизацию и перевооружение на ракетный комплекс «Калибр». Ожидается, что первой лодкой с крылатыми ракетами станет Б-261 «Новороссийск», чей спуск на воду ожидается летом 2013 года. С учетом закрытых водных пространства на Балтике и Черном море, пока альтернатив этим лодкам нет. Тем более, что проект довольно удачный и пользуется большим экспортным успехом. В то же время, «Варшавянки» нашли свою нишу и на Северном флоте с его достаточно большими глубинами. Предполагается, что в случае начала боевых действий за счет высокой скрытности дизельные подлодки прикроют выход на оперативный простор как стратегических ракетоносителей, так и многоцелевых подводных лодок. По сути, «Варшавянки» будут выступать неким подвижным «минным полем».
На смену «Варшавянкам» должен был прейти прийти проект 677 «Лада». Но долгая доводка головной лодки проекта, «Санкт-Петербурга», подставила под сомнение дальнейшую судьбу этого проекта. Однако постройка новых лодок проекта «Лада» по обновлённому проекту с воздухонезависмой энергетической установкой, кажется, стала делом решенным. Сейчас идут опытно-конструкторские работы по установке ВНЭУ на лодки проекта 636 и 877.