Задача примирения этих двух радикально различных трактовок и превращения соглашений о перемирии в мирные договоры была возложена ООН на Палестинскую согласительную комиссию (ПКС). ПКК пригласила Израиль и его соседей на конференцию в Лозанну, которая продолжалась с перерывами с апреля по сентябрь 1949 года. Израильтяне участвовали в ней неохотно, поскольку с самого начала рассматривали конференцию как бесплодный дипломатический ход и не возлагали на нее никаких надежд. Что касается процедуры, то Израиль предпочитал прямые двусторонние переговоры с каждой из арабских сторон спора, тогда как ПКК могла предложить лишь непрямые переговоры между Израилем и арабскими делегациями в целом. Что касается существа вопроса, то было предсказуемо, что на Израиль будет оказано давление с целью заставить его пойти на уступки ради мира, когда его основополагающей позицией является сохранение демографического и территориального статус-кво. Поэтому израильтяне подошли к Лозаннской конференции в настороженном и оборонительном настроении, потратили все свое время на борьбу с давлением со стороны ПКК и правительства США и вздохнули с облегчением, когда конференция закончилась безрезультатно. Вся конференция, по словам одного из членов израильской делегации, была «упражнением в тщетности».
Арабские правительства также подошли к Лозаннской конференции в бескомпромиссном настроении. Им удалось в определенной степени сплотить ряды перед лицом общего врага и горьких последствий поражения; они координировали свою политику и выступали единым фронтом в отношениях с ПКК. Отвергнув резолюцию ООН о разделе территории от 29 ноября 1947 г., они теперь хотели вернуть время назад и использовать ее в качестве основы для урегулирования отношений с Израилем. Послевоенный статус-кво был для них абсолютно неприемлем в качестве основы для урегулирования. На самом деле их позиция была гораздо более экстремальной, чем это казалось в то время. Выработанная Лигой арабских государств, она была обязательной, по крайней мере, теоретически, для всех стран-участниц. Из внутреннего отчета генерального секретаря Лиги арабских государств следует, что официальная позиция заключалась в том, что территория еврейского государства должна быть такой, как определено в резолюции ООН о разделе, но с двумя оговорками. Во-первых, некоторые части еврейского государства должны быть отделены, чтобы освободить место для беженцев, которые не воспользовались своим правом вернуться в свои родные места. Во-вторых, если Израиль решит оставить за собой часть территорий, захваченных в ходе войны, он должен будет компенсировать это арабам, передав им другие части, выделенные ООН еврейскому государству. Одним словом, Лига арабских государств после проигранной войны предложила предоставить Израилю еще меньше территории, чем это было сделано картографами ООН в 1947 году.
На Лозаннской конференции двумя основными предметами спора были беженцы и территория. Позиция Израиля по первому вопросу была ясной и четкой: арабские государства ответственны за проблему беженцев, поэтому ответственность за ее решение лежит на них. Израиль готов внести скромный финансовый вклад в решение этой проблемы, но только в рамках общего урегулирования конфликта и только при условии, что беженцы будут переселены в арабские страны. По второму вопросу позиция Израиля заключалась в том, что постоянные границы между ним и его соседями должны быть основаны на линиях прекращения огня, с незначительными корректировками.
Арабские представители отказались вести прямые переговоры с Израилем и настаивали на том, чтобы иметь дело с ПКК как с единой, объединенной делегацией. Они хотели поставить проблему беженцев на первое место в повестке дня, утверждая, что только Израиль несет ответственность за исход палестинцев. Они также требовали, чтобы всем беженцам был предоставлен выбор между возвращением в свои дома и получением компенсации. Предложение Израиля установить постоянные границы на основе линий прекращения огня было отвергнуто, и каждая арабская делегация потребовала далеко идущих изменений в границе своей страны с Израилем.
По инициативе израильских официальных лиц были организованы секретные встречи с отдельными членами арабских делегаций, но они не привели ни к какому прогрессу и вызвали лишь упреки со стороны ПКК. КПК обвинила израильских чиновников в том, что они действуют за ее спиной; израильтяне ответили, что именно собственные процедуры комиссии вынуждают их искать прямых контактов с арабскими коллегами. Элиас Сассон доложил своему начальству о серьезности ситуации и призвал его к иному подходу. По его мнению, Израиль не может рассчитывать на то, что арабские страны выполнят все его требования в полном объеме, если сам Израиль не готов пойти навстречу им.