Интриги и тайные переговоры Франциска о браке своей сестры с английским королём продолжались всё лето 1526 года. Однако страсть Генриха VIII к Анне Болейн вскоре стала общеизвестной и обсуждалась на всём континенте. Герцогиня Алансонская остро чувствовала, насколько унизительным для неё было соперничество с бывшей фрейлиной за руку монарха, жена которого была ещё жива. И не скрывала от матери, насколько ей отвратителен этот брак, «долженствовавший совершиться за счёт благополучия несчастной королевы Екатерины Арагонской».
Привязанность к королю Наварры также бесконечно усилила беспокойство Маргариты бесцеремонными действиями брата. Переговоры французских послов в Англии в этот период были окутаны большой тайной, ибо Франциск, который хорошо понимал беспринципный и капризный характер Генриха VIII, изо всех сил старался не скомпрометировать себя. Наконец, он убедился, что если король Англии добьётся развода, Анна Болейн разделит с ним трон. Кроме того, Франциска убедили, вероятно, мать и Монморанси, что репутация его сестры значительно пострадает, если тайные предложения, которые он делал Вулси, чтобы добиться брака Маргариты с Генрихом VIII, станут известны после развода последнего с королевой Екатериной.
Что же двигало Анном? Заслуги маршала в деле освобождения Франциска ценились очень высоко, его влияние росло с каждым днем, тем более что те люди, которые могли успешно с ним соперничать, понемногу сходили со сцены: Луиза всё чаще болела, канцлер Дюпре старел, а из прежних близких товарищей короля оставались при дворе лишь немногие. Вскоре Монморанси встал во главе католической партии, которая не желала допустить брака между Генрихом VIII и Маргаритой. Сделавшись английской королевой, получив силу и власть, не станет ли она открыто на сторону реформаторов? И не склонит ли к тому же своего брата и своего супруга?
Правда, историк Мишле утверждает, что будто бы король уступил желанию Анны де Писсле, боявшейся влияния Маргариты на её брата и стремившейся удалить её от двора. Однако отношения между королевской фавориткой и герцогиней Алансонской всегда были хорошие.
Так или иначе, но во второй половине 1526 года Франциск I неохотно дал согласие на брак своей сестры с королём Наварры.
Официальная помолвка Маргариты, вероятно, состоялась примерно в ноябре месяце или в начале декабря во дворце Сен-Жермен-ан-Лэ, куда Мадам переехала из Парижа. После этой церемонии герцогиня Алансонская снова отправилась на юг, во владения Генриха д’Альбре. В письме, которое она написала графине де Ларошфуко, Маргарита говорит о себе как о «путешествующей в сопровождении короля Наварры». Сопротивление Франциска её браку, похоже, тогда не было полностью ещё преодолено, поскольку принцесса сообщила подруге, что в настоящее время не смеет пригласить никого из своих родственников на церемонию венчания.
— Моя кузина, — писала Маргарита, — вчера король Наварры решил, что я должна покинуть это место в следующую пятницу. В субботу я буду в Тарбе, где останусь, чтобы присутствовать на приближающемся празднике, а оттуда отправлюсь в Прей, где я намереваюсь немного погостить и надеюсь увидеть Вас там…
Прей, или Сен-Прей, где герцогиня Алансонская выразила намерение отдохнуть несколько дней, был маленьким городком в Лангедоке. Причиной её пребывания там, несомненно, было посещение сестры короля Наварры, Екатерины д'Альбре, которая приняла постриг в тамошнем монастыре. Всего же у её будущего мужа было четыре сестры: близнецы Мария и Екатерина стали монахинями, Анну обручили с графом д'Эстраком, старшим сыном графа де Кандаля, а Изабелла, красоту которой воспел поэт Маро, жила при дворе своего брата, и пока оставалась незамужней.
По возвращении Маргариты в Сен-Жермен её брачный контракт, наконец, был подписан братом. Этот документ был составлен под руководством Мадам 3 января 1527 года: «Ниже приведены статьи и договор о браке между высокородными и могущественными принцем и принцессой, монсеньором Генрихом, милостью Божьей, королём Наварры, сеньором Беарна, сыном высокородных и могущественных Жана и Екатерины, по той же милости покойных короля и королевы Наварры, герцога и герцогини Ганди, де Монблан и де Пенафьель, графа и графини де Фуа, сеньора и дамы Беарн и Бигорр, и мадам Маргариты Французской, единственной сестры короля, герцогини Алансонской и Беррийской, графини де Родд, дю Перш, де Лиль, виконтессы де Ломень и дамы де Божё».