В 1964 году Тибетское правительство в изгнании сняло запрет, наложенный на перерождения и деятельность Шамарпы. Ринпоче был официально возведен на трон, и Кармапа объявил его вторым после себя держателем линии преемственности. Возвращение Шамарпе его титула и положения после 170-летнего запрета Его Святейшество Рангджунг Ригпе Дордже считал одним из своих главных достижений.
После ухода Шестнадцатого Кармапы Шамар Ринпоче, храня верность своему Учителю, решил отыскать подлинное перерождение Кармапы и сберечь линию преемственности Карма Кагью. Практически в одиночестве он отстаивал истину перед лицом могущественных политических сил. В соответствии со своей духовной традицией, он официально признал тринле тхае Дордже как Семнадцатого Кармапу и в 1994 году возвел его на трон. Церемония состоялась в Международном институте Кармапы (KIBI) в Нью-Дели. В последующие годы тхае Дордже получил от него всю передачу вместе с поучениями и посвящениями.
Откликаясь на печальное известие о кончине своего Учителя, Его Святейшество Кармапа XVII написал из KIBI письмо, в котором упомянул коренные поучения Будды о непостоянстве и заверил учеников в том, что, хотя физическое проявление Ринпоче покинуло этот мир, его роль как учителя продолжается, а благословение и пожелания останутся с нами навсегда.
Сразу после этих событий все выдающиеся буддийские учителя, с которыми Шамар Ринпоче поддерживал близкие связи, выразили соболезнования его ученикам и родственникам, и в первую очередь его брату Джигме Ринпоче. В послании лам непальского монастыря Ка Ньинг Шедруб Линг, которым руководит Чёкьи Ньима Ринпоче, эхом отозвались чувства бесчисленных последователей Дхармы отовсюду: «Как будто чернота ночи внезапно поглотила наш мир».
По просьбе Кармапы Тхае Дордже тысячи практикующих в центрах Карма Кагью по всему миру медитировали на Амитабху, Будду Безграничного Света. Лама Оле Нидал написал своим ученикам, что Шамарпа, «будучи Бодхисаттвой с уникальными качествами – как во время инкарнаций, так и между ними, – предоставляет многим неразрушимые возможности впитывать различные аспекты его благословения и постижения истины».
Незадолго до своей кончины Шамар Ринпоче посетил множество буддийских центров Карма Кагью, включая главную европейскую резиденцию Кармапы Дагпо Кагью Линг в Дордони (Франция) и важнейший центр сообщества Дэчен под названием Кагью Линг в Манчестере (Великобритания). Последним из центров Алмазного пути, который Ринпоче благословил в этом воплощении, стал институт Буфой в Лондоне. Затем Ринпоче прибыл в Ренхен Ульм – европейский штаб его собственной сети центров Путь Бодхи, над созданием которой он работал с середины 90-х годов прошлого века.
Кроме множества других заслуг перед буддийским миром, своей известностью Шамар Ринпоче обязан той роли, которую он сыграл во время кризиса, разразившегося в линии преемственности Карма Кагью после кончины Кармапы XVI. Его позиция вызвала огромную благодарность одних современников и едкое негодование других. Немногие знают, насколько преданно он защищал традицию Карма Кагью и своих учеников, избавляя их от влияния раскольничества и китайско-Тибетской геополитики. Ему удалось преодолеть множество невзгод и препятствий.
В среде Тибетских ринпоче Шамарпа выделялся поразительной бескомпромиссностью. Он отказывался участвовать в чужих играх или терпеть манипуляции. Он не боялся бросать вызов, когда чувствовал, что это правильно, не заботился о своей репутации и не поддавался влиянию. Шамара Ринпоче отличали честность, отвага и абсолютное бесстрашие; стабильный, как скала, и непоколебимо преданный своим убеждениям, он не пасовал ни перед какими препятствиями и всегда смотрел вперед.
Полностью сознавая важность своей позиции, он никогда не опускался до гордости или высокомерия, сочетая в себе достоинство, солидность и скромность. Обладая природной мягкостью и сочувствием, при необходимости он действовал прямо и решительно, особенно когда речь шла о сложных перепитиях восточной политики. В частности, это проявилось в его открытом письме, написанном в 2006 году профессору Роберту Турману, который вмешался в проблемы школы Карма Кагью. В этом послании Ринпоче ввел в обращение термин «пакетные верующие»