Согласно боевому донесению 5-го Воздушного флота в 16:08 с аэродрома Банак на бомбардировку части конвоя PQ-16, идущей в направлении Иоканьги, вылетели 10 Ю-88 1-й группы и отряда Erpr.St./KG30. Экипаж одного «Юнкерса» доложил, что в 18:35 сбросил 4 бомбы SC250 с планирования с высоты 2400 до 700 метров по транспорту (7000 брт) в 50 километрах севернее Иоканьги, при этом наблюдал прямое попадание одной бомбы по транспорту, на котором наблюдалось сильное дымообразование. Транспорт считался поврежденным, но это не подтверждается. Остальные «Юнкерсы-88» произвели атаку безрезультатно, всего было сброшено 36 бомб SC250. По докладу экипажей Ю-88, зенитная артиллерия кораблей среднего и мелкого калибра вела сильный, но безрезультатный огонь, а также наблюдался полет на высоте 1500 метров двух наших истребителей.
Наши сведения об этом налете были следующими. В 10 милях севернее мыса Святой Нос группа в составе 10 Ю-88 в 18:36 безрезультатно бомбардировала сторожевой корабль СКР-15 (№ 74), который шел ко второй части конвоя PQ-16 и вскоре присоединился к эскорту. Также из этой группы «Юнкерсов-88» четыре самолета отбомбились по второй части конвоя PQ-16 в районе Иоканьги, причем три Ю-88 сбросили бомбы с горизонтального полета и лишь один — с пикирования. Бомбардировка была безрезультатной.
В 16:15 на командном пункте ВВС Северного флота было получено сообщение о вылете в 15:48 группы самолетов противника с аэродрома Банак, сообщение было явно от службы радиоразведки Северного флота. В 16:55 было отдано распоряжение в 95-й ИАП об отправке двух Пе-3 на прикрытие второй части конвоя PQ-16, идущего в Белое море в порт Архангельск, с последующей сменой в воздухе. Расчет был верным на начало патрулирования Пе-3 перед подходом бомбардировщиков с аэродрома Банак. Однако по какой-то причине выпуск первой пары Пе-3 был уже после бомбардировки: пара Пе-3 95-го ИАП капитана Горкушенко вылетела на прикрытие конвоя в 19:10. Патрулирование над конвоем началось в 20:05. В точке с координатами Ш=67°48′, Д=41°00′ один Пе-3 капитана Горкушенко в 20:45 был обстрелян из пулемета гидросамолета МБР-2, в результате у «Петлякова» был отбит один винт вместе с редуктором. При возвращении на свой аэродром все сторожевые корабли, стоявшие вдоль побережья, вели огонь по этому Пе-3, что произошло явно на фоне предыдущих атак «Юнкерсов-88». К счастью, все обошлось благополучно, капитан Горкушенко произвел нормальную посадку с одним работающим мотором. Вторая пара Пе-3 вылетела к транспортам в 20:33, третья пара Пе-3 — в 22:09, она была атакована патрулировавшими над транспортами двумя И-153. В обоих случаях наши летчики на устаревших самолетах И-153 и МБР-2, прикрывая конвой, с больших дистанций приняли «Петляковых» за самолеты противника и, полные решимости не допустить их к конвою, атаковали Пе-3. Всего пары Пе-3 95-го ИАП три раза вели патрулирование над этой частью конвоя, противник при этом не появлялся.
Вторая часть конвоя PQ-16 в составе 6 транспортов и кораблей охранения без потерь прибыла в Архангельск 1 июня в 15:00, на этом завершилась совместная операция союзников по проводке и обеспечению каравана PQ-16, но на этом борьба за транспорты конвоя и его грузы не закончилась. В порты Мурманска и Архангельска прибыли 27 транспортов, из них в мурманский порт — 21 транспорт, которые доставили: 376 танков типа М-3‚ «Матильда» и «Валентайн»‚ 32 локатора GL-2‚ 176 самолетов (123 «Харрикейна»‚ 47 Р-40‚ 3 Р-39 и первые три А-20 «Бостон»)‚ 52,5 т различного вооружения, 3284,3 т боеприпасов, 561,3 т пороха.