После обнаружения вражеского конвоя, идущего из порта Киркенес в сторону Варде, на торпедный удар в 09:00 вылетели 3 ДБ-3Ф 6-й торпедоносной эскадрильи 2-го ГКАП, которые в 10:20 с высоты 3100 метров сбросили две высотные торпеды 45-36АВ-А по транспортам в проливе Буссесунд (о. Варде). По докладу экипажей, одна торпеда приводнилась в районе транспортов, вторая упала на сушу, при этом противник отметил сброс двух парашютных торпед в районе порта Варде в период 10:04–10:15, но без каких-либо повреждений. Действия торпедоносцев обеспечивали 7 «Харрикейнов» и 2 «Киттихаука» 2-го ГКАП, которые в период 09:38–10:40 вылетали на отсечку в район Вайтолахти на высоту 3500 метров.
В период 12:18–14:00 пара Пе-3 95-го ИАП вылетала на бомбардировку сторожевого корабля противника, который обнаружил нашу подводную лодку в районе Варде. Не обнаружив корабля, экипажи отбомбились по порту Варде, при этом доложили о попаданиях по причалу, время сброса бомб (4 ФАБ-100 и 4 ФАБ-50) не указывается. В боевом донесении 5-го Воздушного флота и донесениях сухопутных войск отмечено, что этот налет на Варде был в период 13:15–13:21, два бомбардировщика сбросили 8 бомб с высоты 3500 метров, в результате бомбардировки на береговой батарее № 542 был убит 1 солдат, 3 тяжело— и 7 легкораненых, также попадания были в районе расквартирования подразделения 11./J.R.388, где было 2 тяжелораненых и 28 легкораненых.
В 13:00 для бомбардировки вражеского конвоя, с которым, по расчету, встреча должна была произойти на подходе к Тана-фьорду, вылетели 3 СБ 2-го ГКАП, но они транспортов не обнаружили и в 14:26 также отбомбились по порту Варде. Сброс бомб (18 ФАБ-100 и 6 ФАБ-50) был с высоты 5600 метров. Экипажи наблюдали попадания бомб по 7 зданиям и радиостанции, возник пожар, по данным противника, бомбы попали по жилым кварталам, где были разрушены несколько жилых домов, погибли два норвежца и несколько человек гражданского населения получили ранения.
Таким образом, 2 июня ВВС Северного флота впервые вели целенаправленные действия торпедоносной и бомбардировочной авиации по обнаруженному вражескому конвою. Истребительная авиация противника не оказала какого-либо противодействия из-за того, что аэродромы находились далеко от района Варде — Тана-фьорд.
По данным противника, с аэродрома Банак по тревоге дважды вылетали пары «Мессершмиттов-109» 4-го отряда в 02:18 и в 11:28, но встречи с нашими самолетами у них не было. Эти вылеты говорят о том, что пара или звено истребителей Ме-109 были перебазированы с аэродрома Алакуртти специально для прикрытия аэродрома Банак после бомбардировок самолетами Ил-4 этого аэродрома в течение 27–31 мая. Таким образом, бомбардировки аэродрома Банак вынудили противника ослабить истребительное подразделение на аэродроме Алакуртти.
Противник начал день с воздушной разведки. В период 04:50–10:10 «Юнкерс-88» из отряда 1.(F)/124 произвел разведку мурманского побережья, доложив о нахождении в районе Иоканьги 7 грузовых судов, 1 эсминца и 4 сторожевых катеров (в действительности это были сторожевые корабли и тральщики). Еще один Ю-88 из отряда 1.(F)/124 вылетел в 09:49 на разведку аэродромов Ваенга-1 и 2, по докладу экипажа, в районе Мурманска его атаковали 4 «Харрикейна», от которых удалось уйти изменением курса.
В течение дня авиация противника предприняла два налета на мурманский порт с целью уничтожения судов конвоя PQ-16. Согласно боевому донесению 5-го Воздушного флота в 10:15 с аэродрома Хебуктен на бомбардировку кораблей в Кольском заливе вылетели 9 Ю-87, их сопровождали 4 Ме-110 и 20 Ме-109 2-й и 3-й групп. Экипажи «Юнкерсов-87» доложили, что в 11:30 сбросили бомбы (9 SC500 и 36 SC50) с пикирования с высоты 5500 до 1500 метров по двум большим транспортам, пришвартованным к причалу в мурманском порту, при этом наблюдали попадания бомб на причале рядом с двумя большими транспортами. Оба транспорта считались поврежденными, но в действительности транспорты не пострадали, от разрывов бомб повреждения получило вспомогательное судно — корабль подстанции. Подводная лодка Щ-404, стоявшая у причала судоверфи, получила пробоину цистерны главного балласта № 5, вылетела одна заклепка прочного корпуса (повторные повреждения эта подлодка получила 30 июня и была отремонтирована 15 сентября 1942 года). По докладу экипажей Ю-87, по ним вела очень сильный и точный огонь зенитная артиллерия всех калибров, а также противодействовала сильная оборона истребителей. Потери в боевом донесении были отмечены следующие: один Ю-87 сбит при перехвате истребителями; второй Ю-87 разбился западнее Мурманска после обстрела зенитной артиллерией; третий Ю-87 получил пушечную пробоину в плоскости крыла и пулеметные пробоины в фюзеляже и винте.