До 2001 г. талибы стремились к признанию и поддержке США и не одобряли антиамериканские кампании и глобальный джихад. Начало своих несчастий талибы отождествляют с приходом в 2001 г. в Афганистан международной коалиции во главе с американцами. Поэтому неудивительно, что изгнание «захватчиков» всегда было основной идеей, помогающей осуществлять вербовку в ряды «Талибана». Культурные трения, злоупотребления и жертвы среди гражданского населения, вызванные операциями западных войск, вызвали недовольство, особенно в самых консервативных кругах афганского общества, где было широко распространено мнение, что представители Запада пытаются переделать страну по своему образу и подобию. Эти местные факторы, а не глобальная исламистская идеология, являются основным источником идеологии талибов, распространенной как среди их лидеров, так и среди рядовых последователей.
После 2001 г. отношения между «Аль-Каидой» и «Талибаном» поначалу были довольно прочными, хотя бы по той причине, что «Аль-Каиде» больше некуда было деваться, а «Талибан» нуждался в любой помощи, которую только мог получить. Однако примерно в 2010 г. эти отношения начали ухудшаться, поскольку «Аль-Каида» и союзные ей организации, такие как Исламское движение Узбекистана (ИДУ), узнали об усилиях высокопоставленных деятелей «Талибана», направленных на начало переговоров с США. «Аль-Каида» была не в состоянии порвать с талибами, но она начала сосредоточивать свою поддержку на тех фигурах и лидерах, которые, по ее мнению, могли остановить волну примирения. Эти усилия не принесли результатов: одним из лидеров, которых некоторое время поддерживала «Аль-Каида», был Ахтар Мохаммад Мансур, впоследствии ставший главным пропагандистом примирения.
Смерть бен Ладена в 2011 году мало что изменила. На протяжении многих лет присутствие «Аль-Каиды» то усиливалось, то ослабевало, но всегда было второстепенным с точки зрения численности – число ее приверженцев составляло всего несколько сотен человек, которым было поручено создать несколько тренировочных лагерей и консультировать некоторые группы талибов. В основном влияние «Аль-Каиды» сказывалось в целевом распределении средств, а их поток сильно колебался в зависимости от того, что доноры «Аль-Каиды» были готовы заплатить, и от того, каких поступлений требовали другие театры действий «Аль-Каиды».
«Аль-Каида» надеялась, что политика перехода ответственности за положение в стране от войск НАТО к собственным силам безопасности Афганистана и вывод войск США в 2014 г. позволят ей снова расширить свое влияние и свои операции в Афганистане. Это помогло бы талибам одержать победу, а затем Афганистан можно было бы использовать в качестве плацдарма для экспорта джихада в окружающий регион. Финансирование организации возобновилось из-за гражданской войны в Сирии, где «АльКаида» была очень активна. Вместо этого появление в 2015 году «Исламского государства» в Афганистане подорвало планы «Аль-Каиды» и превратилось в прямой вызов ее давним базам на востоке, ассимилировав некоторых давних союзников организации, таких как многие среднеазиатские боевики, базирующиеся в Афганистане, фронт Дост Мохаммеда на востоке и, со временем, даже некоторые из (группировки) Хаккани.
В целом «Аль-Каида» оставила в Афганистане некоторое идеологическое наследие, но в основном ее плоды пожинало «Исламское государство». В настоящее время «Аль-Каида» в Афганистане как никогда слаба, особенно на востоке, где ей приходилось выдерживать атаки со стороны США в течение многих лет.
По очевидным причинам после 2001 г. ни одно правительство никогда публично не признавалось в поддержке талибов. Также очевидно, что, начиная с 2002 года, талибы пользуются безопасным убежищем в Пакистане, а в последнее время и в Иране. Имеются свидетельства того, что оружие китайского производства передается талибам через Пакистан, особенно на востоке, и что к ним, особенно на западе, попадает также иранское оружие. Известны случаи оказания и другой пакистанской и иранской помощи, в частности в подготовке кадров. Источники «Талибана» открыто говорят о крупномасштабном (десятки миллионов долларов в год) финансировании, поступающем из источников в Пакистане, Иране и Саудовской Аравии, хотя некоторые из этих сведений могут быть объяснены хвастовством. Опыт талибов в изготовлении бомб был полностью позаимствован в Пакистане, в то время как иранцы обеспечили более продвинутую тактическую подготовку, чем это могли сделать пакистанцы. Степень, в которой Пакистан выделял собственные средства на поддержку движения «Талибан», неясна, поскольку, как сообщается, он переводил ему средства, поступающие из других источников (главным образом из Саудовской Аравии).