Конституционная Лойя Джирга должна быть созвана в течение восемнадцати месяцев после создания Переходного органа, с тем, чтобы принять новую конституцию Афганистана. Для оказания Конституционной Лойя Джирге помощи в подготовке предложенной Конституции, Переходная администрация в течение двух месяцев с момента начала ее работы и при содействии Организации Объединенных Наций должна создать Конституционную Комиссию[35]
.Конституционная Лойя Джирга была созвана 13 декабря 2003 г. и приняла конституцию 4 января 2004 г. Она обсудила текст, подготовленный перед этим немногочисленной комиссией, работавшей с октября 2002 г. по март 2003 г. Эта комиссия представила упомянутый текст Комиссии по пересмотру Конституции (CRC), которая с марта 2003 г. по сентябрь 2003 г. изучала и редактировала его. В сентябре 2003 г. CRC представила свой проект Совету национальной безопасности под председательством президента Карзая, который внес в него существенные изменения до его представления в Конституционную Лойя Джиргу.
На Конституционной Лойя Джирге было сильное ощущение, как выразился один делегат, что «пуштуны вернулись». То, что многие пуштуны воспринимали как непропорциональное представительство непуштунов, особенно таджиков, в предыдущем правительстве, теперь закончилось. Пуштуны победили в главном вопросе, создав централизованное правительство и государство, возглавляемое напрямую избранным президентом. Члены конституционной комиссии и делегаты Конституционной Лойя Джирги от других этнических групп предлагали различные формы разделения власти и децентрализации, включая парламентскую систему, в которой глава правительства (премьер-министр) представлял бы многонациональную коалицию, созданную в парламенте. Предлагались также: смешанная система, в которой президент и премьер-министр были бы наделены полномочиями проверять деятельность друг друга; выборы местных представителей власти, таких как губернаторы и губернаторы округов; назначение местного начальства избранными советами. В проекте, представленном Комиссией по пересмотру Конституции (CRC), предлагалась смешанная система, в которой присутствовали как президент, так и премьер-министр, но Совет национальной безопасности (NSC) изменил ее на чисто президентскую. Именно этот проект и поступил на рассмотрение Конституционной Лойя Джирги.
В то время как пуштуны добились наиболее благоприятного для них результата в отношении формы правления, по явно этническим вопросам конституция достигла, хотя и с трудом, требуемого баланса сил, став в некоторых отношениях наиболее инклюзивной конституцией из всех прежде существовавших в стране. Пушту и дари получили равное признание в качестве «государственных языков», в то время как представители других народностей стали пользоваться правом иметь собственные учебные заведения и средства массовой информации, где использовались их родные языки. Конституция восстановила требование о том, чтобы государственный гимн исполнялся на языке пушту (правительство Раббани приняло гимн на дари), но взамен этого потребовала, чтобы в гимне упоминались все четырнадцать этнических групп, перечисленных в качестве составляющих афганскую нацию народностей в Статье 4.
Лица, близкие к президенту Карзаю, в попытке подтвердить преобладание пуштунского языка включили в конституцию уже после того, как она была одобрена, пуштунские слова. После их правки конституция стала требовать применения «национальной терминологии», представляющей собой использование пуштунских терминов для наименования некоторых учреждений, таких как
Конституция признала ислам государственной религией, но не указала, как это было в предыдущих конституциях, что официальные религиозные ритуалы должны проводиться в соответствии с ханафитскими (суннитскими) обрядами. Тогда как только ханафитская школа была предписана как источник остаточной юриспруденции там, где писаный закон молчит, конституция признала шиитскую юриспруденцию в делах семейного права среди шиитов.