Позиция Перу нашла поддержку в Боливии, Чили и Эквадоре, так как каждое из этих государств могло стать следующей целью для агрессивных действий Испании. С другой стороны, являлось очевидным, что испанцы не имели никакого намерения вернуть себе свои прежние колонии. Для этого не имелось ни сил, ни средств, ни желания. Испанское правительство активной внешней политикой пыталось отвлечь внимание испанцев от внутренних проблем, но не было никаких гарантий, что события в Мексике и Санто-Доминго это не попытка реставрировать испанскую колониальную империю. Поэтому чилийский президент отказал в пополнении запасов угля испанской канонерской лодке "Венседора" на том основании, что уголь - это военная поставка, а значит, по условиям международного права не может быть продан ни одному из воюющих государств. Однако вскоре испанцы задержали два чилийских парохода с оружием для Перу.
В такой ситуации чилийские заявления о нейтралитете звучали странно. Адмирал Пареха проводил твердую линию на ужесточение санкций против Чили и двинул к побережью Чили четыре своих фрегата, оставив для блокады порта Кальяо броненосец "Нумансия" и шхуну "Ковадонга".
17 сентября 1865 г. адмирал Пареха на борту флагманского фрегата "Вилья де Мадрид" прибыл в Вальпараисо и потребовал приветствовать государственный флаг Испании артиллерийским салютом. Гордые чилийцы отказались выполнить требование. Спустя неделю была объявлена война. Вновь ставший главой испанского правительства Леопольдо О'Доннел поддержал Пареху. Располагая незначительными силами и кораблями, нуждавшимися в ремонте, Пареха решил блокировать 1800 миль побережья Чили. Отсутствие сухопутных сил не позволяла высаживать десанты, и фактически единственным действием испанцев стала блокада главного торгового порта чилийцев Вальпараисо.
8 ноября перуанский президент Хуан Антонио Песет был вынужден уйти в отставку, и был заменен вице-президентом генералом Педро Диесом Кансекой. Однако Кансеко также пробовал избежать столкновения с Испанией, и 26 ноября генерал Мариано Игнасио Прадо, лидер националистического движения, сверг его. Прадо немедленно объявил о солидарности с Чили и о том, что Перу находится в состоянии войны с Испанией.
В ноябре 1865 г. единственный чилийский военный корабль специальной постройки - корвет "Эсмеральда" под командой Хуана Вильямса Реболедо - патрулировал чилийское побережье с целью перехвата испанских судов, которыми могла пополниться эскадра Парехи. В экипаж корвета входили будущие герои Второй Тихоокеанской войны между Чили и Перу Артуро Прат, Хуан Хосе Латорре и Карлос Конделл. 26 ноября, обнаружив испанскую военную шхуну "Ковадонга" около прибрежного городка Папудо, в 55 милях от Вальпараисо, чилийцы пошли на хитрость и подняли флаг Великобритании. "Эсмеральда" была построена в Британии и имела в британском флоте однотипные корабли, а потому испанцы не распознали хитрости и позволили приблизиться к себе. Сблизившись, чилийцы открыли огонь и вскоре, получив некоторые повреждения, испанская шхуна предприняла неудачную попытку сбежать, после чего испанский командир сдал врагу свой корабль. Бой длился около 30 минут. В плен попало 6 офицеров и 115 рядовых, а также была захвачена почта из Испании к адмиралу Парехо. Чилийцы потеряли только 1 человека убитым и 21 раненым. После ремонта, Мануэль Томсон был назначен командиром уже чилийской шхуны с прежним названием "Ковадонга".
27 ноября Пареха совершил самоубийство. Причиной стал не только результат боя при Папудо, но и то, что все его действия по блокаде Чили не приносили никаких заметных результатов, а экипажи кораблей были деморализованы огромной нагрузкой и абсолютной бесперспективностью ведения войны имеющимися силами. Когда 26 ноября американский консул в разговоре с адмиралом небрежно упомянул о захвате чилийцами "Ковадонги", то Пареха был совершенно потрясен. Шхуна стала уже вторым кораблем, потерянным испанцами после того, как год назад сгорел фрегат "Триунфо". На следующий день Пареха оделся в парадную форму и застрелился.
Испанское общественное мнение было разгневано и требовало мести. Одна из испанских газет писала о потере шхуны "Ковадонга": "...пусть, если это необходимо, погибнет наш эскадрон в Тихом океане, чем будет потеряна честь страны...". Новым командиром испанской Тихоокеанской эскадры стал капитан броненосца "Нумансия" Касто Мендес Нуньес.