Питаясь из этих различных источников, испано-атлантическая торговля росла и, по всей видимости, процветала. Однако она всегда была сопряжена с риском. Использование более крупных до определенных пределов кораблей не добавляло безопасности; напротив, самые большие корабли – трудноуправляемые, тяжеловооруженные, зачастую перегруженные – были более опасны, чем корабли средних размеров, особенно в открытых гаванях, которые приходилось использовать кораблям, ходившим в Индии. Среди самых тяжелых катастроф можно назвать катастрофы 1563 г. (7 кораблей выброшены на берег в Номбре-де-Дьос, 15 потерпели крушение в гавани Кадиса, 5 были потеряны в заливе Кампече), 1587 г. (6 кораблей сели на мель и разбились на банке в Санлукаре), 1590 г. (15 кораблей выброшены на берег сильным северным ветром в гавани Веракрус), 1591 г. (16 кораблей потерпели крушение у острова Терсейра), 1601 г. (14 кораблей в Веракрусе, опять сильный северный ветер), 1614 г. (7 кораблей потерпели крушение у мыса Каточе). Многие из этих потерь были вызваны ошибками в судовождении, но частота посадок на мель в знакомых гаванях тоже дает повод прокомментировать характеристики управляемости кораблей. Пропавшие корабли вовсе не были большими, это так, и не все они были испанскими, так как судовладельцы, участвовавшие в торговле, часто использовали корабли иностранного происхождения – фламандские, голландские или португальские, когда могли обойти закон. Тем не менее очевидно, что в испанском, как и в португальском, кораблестроении размер опережал конструкторскую мысль.