План мечети представляет собой чуть вытянутый в поперечном направлении прямоугольник 18,8 х 15,3 м, перекрытый 13-метровым куполом, поддерживаемым четырьмя угловыми полукуполами на парусах, закрытых сталактитами. В данном случае архитектор отказался от глубокой михрабной ниши и введения пятого полукупола, а использование наружных контрфорсов позволило ограничить членение стены киблы лишь пилястрами, что придало интерьеру компактность, простоту и ясность. Введение боковых галерей выделило в плане четкий подкупольный квадрат, а отсутствие полноценных нефов заставляет воспринимать пространство как расширяющееся кверху. В отличие от Семиз Али-паша-джами и подобных ей мечетей галереи не пристраиваются к опорным столбам – в постройке в Кадырга два столба на поперечной оси превращены в пристенные (им соответствуют контрфорсы на внешних боковых стенах); таким образом, в очередной (и последний) раз обратившись к опорному шестиугольнику, Синан отказался от отдельно стоящих опор. Галереи закрывают метровые выступы столбов в зал, скрывая несущую конструкцию, которая была четко выявлена и в Синан-паша-джами, и в других синановских мечетях-гексагонах; при этом столбам соответствуют более узкие и пониженные центральные арки поддерживающих галереи аркад. С северной стороны интерьер расширен глубокими лоджиями, обрамляющими входной портал, стиснутый мощными пилонами, необходимыми для опоры подпружных арок северной пары полукуполов; пробитые в пилонах проходы обеспечивают П-образный обход подкупольного пространства по галереям с подъемом на центральную ложу, помещенную над порталом.
Главным мотивом декорации интерьера оказывается контраст между мягким теплым оттенком каменной облицовки стен и опорных элементов и насыщенным синим цветом изразцовых панно, покрывающих паруса купола и центральное прясло стены киблы. Этот прием акцентирует и «вектор ислама», и индицирующую его михрабную нишу, «раскрывающуюся» балдахином над собравшимися на молитву, выделяя лишь «то, что перед…» и «то, что над…». Отделка интерьера мечети изникскими изразцами применялась Синаном и ранее (например, в Рустем-паша-джами), но они служили лишь материалом для оформления, «заливкой» поверхностей; в мечети в Кадырга синие панно, отражающие свет, становятся смысловым наполнением пространства молитвы (насколько вообще возможно говорить о какой-либо символике элементов оформления применительно к архитектуре мечети). Важными «статусными» элементами интерьера Соколлу Мехмед-паша-джами стали мелкие фрагменты камней Каабы, предоставленные заказчиком, от имени халифа контролировавшим реставрационные работы в Мекке142
.Северный фасад мечети закрыт портиком