На месте, где сейчас находится этот монастырь, в начале XIV в. была усадьба ростовского боярина Кирилла. Здесь, в боярских хоромах, у его жены Марии родился в 1314 г. сын, которого назвали Варфоломей, со временем он стал самым знаменитым русским игуменом, более того – почитаемым как Игумен Земли Русской. Здесь произошли все события, хорошо известные православным людям. В местном деревянном храме, который до наших дней не сохранился, как рассказывает легенда, будущий святой прокричал в утробе Марии во время каждой из 3 частей литургии. Отрок Варфоломей здесь вместе с родителями прожил первые 14 лет своей жизни, ему было явление Ангела Господня. Здесь, где в полях и лесах он искал отцовских жеребят, он повстречался со старцем-монахом, открывшим в юноше способность к грамоте (которая до этого ему никак не давалась), кроме того, он раскрыл Кириллу и Марии предызбранность их сына. Когда Варфоломею пошел 15-й год, их семья переехала в Радонеж, расположенный на Московских землях.
Троице-Сергиев Варницкий монастырь основал в 1427 г. святитель Ефрем, архиепископ Ростовский
(умер в 1454). Святой Ефрем основал монастырь в память о Сергии Радонежском. Вторая часть названия этого монастыря является сугубо местным топонимом. В этих местах добывали соль в XV–XVII вв., построили многочисленные соленые варницы. Здесь вываривали соль из соляной жижи, извлекаемой из колодцев.В первые годы советской власти монастырь закрыли, он был разграблен. В 1920-е – 1930-е гг. снесли Троицкий собор, колокольню, стены монастыря, кладбище, Введенскую церковь перестроили. Верующие люди рассказывают, что Бог сразу начал карать святотатцев. Когда ломали Троицкий собор и колокольню, с колокольни упал лом и пронзил голову одному из святотатцев. В 1995 г. монастырь вернули Церкви. На месте разрушенного храма во имя преподобного Сергия Радонежского уже построили деревянную часовню. Сейчас в монастыре живут примерно 10 человек братии, работают воскресная школа и книжная лавка. Главными святынями возрожденного монастыря являются: чтимая икона преподобного Сергия Радонежского с частицей его святых мощей; икона святителя Агафангела Исповедника, митрополита Ярославского и Ростовского с частицей его святых мощей (умер в 1928). В 1 км от монастыря находится освященный источник, который раньше был соляным колодцем (поэтому и теперь его нередко называют целебным соляным источником).
В великокняжеский царский период в Ростове Великом было больше действующих монастырей и храмов. По разным причинам многие из них прекратили свое существование или были разрушены. Среди них оказался и Богоявленский Авраамиев мужской монастырь
, основанный в конце XI в. на берегу о. Неро. Но в самые последние годы монастырь стал оживать, правда, пока численность братии этого монастыря – всего несколько человек, из них только один – умудренный монашеской жизнью инок. Этот монастырь основал отшельник Авраамий в конце XI в. в память о том, что по его молитвам при помощи Господа Иисуса Христа и Иоанна Богослова был сокрушен языческий каменный идол Велес или Велос (большой камень) и существенно сократилось число приверженцев язычества в этих местах. Монах Авраамий на месте языческих жертвоприношений, где стоял идол, то есть капища язычников, построил храм в честь Богоявления и основал монастырь. Как гласит легенда, этому предшествовали необыкновенные события. Авраамий усердно молился о сокрушении идола Велеса (у язычников покровителя скота, богатства, торговли), ему явился апостол Иоанн Богослов, который дал ему крестообразный жезл, чтобы сокрушить языческого идола. Авраамий жезлом Иоанна Богослова разрушил каменного идола. Место, где стоял идол Велес, вначале называлось Велесово дворище. Когда идола и все это языческое капище разрушили, то место стали называть Чертово городище. Затем это место по указанию ростовского епископа переименовали в Ангелово, со временем появилась деревня Ангелово. Произошло почти чудо. Со временем именно в этом месте – около деревни Ангелово – родился митрополит Ростовский Иона Сысоевич – строитель Ростовского Кремля, создатель многих храмов на Ростовской земле. Получилось, что на месте языческого капища построили монастырь для борьбы с идолопоклонством и усиления Православия, кроме того, он мог оборонять город от врагов, а затем стал еще и ярким центром распространения идей Православия, одним из оплотов церковно-монастырской колонизации, источником духовно-нравственной поддержки князей и царей в их делах во благо России. Когда монах Авраамий умер, его похоронили в ростовском Спасо-Яковлевском Дмитриевом монастыре. Со временем он был канонизирован, его святые мощи пребывают в ростовском Спасо-Яковлевском Дмитриевом монастыре.