По прошествии торжеств Цезарь приступил к наделению землей ветеранов, провел муниципальный закон (в нем регулировались вопросы городского управления и благоустройства), уменьшил более чем вдвое число лиц, получавших от государства даровой хлеб. Также он распустил восстановленные Клодием религиозные коллегии, осуществил реформу календаря (было введено т. н. юлианское летосчисление), ликвидировал декурию эрарных трибунов (в судебных комиссиях стали заседать лишь сенаторы и всадники), упорядочил сроки отправления промагистратских должностей в провинциях. Кроме того, он принял меры для пополнения рядов римских граждан, издал законы против роскоши, начал крупномасштабную строительную деятельность. Осуществляя все эти преобразования, Цезарь действовал с сугубо прагматических позиций; без какой-то определенной политической программы он решал насущные проблемы, стоявшие перед государственной властью.
В начале декабря 46 г. до н. э. Цезарю пришлось отбыть в Испанию, где к этому времени Гней Помпей Младший сосредоточил под своим командованием 13 легионов и многочисленные вспомогательные войска. В Риме диктатор оставил в качестве своего заместителя Лепида. В январе 45 г. до н. э. началась вторая испанская кампания. После ряда второстепенных столкновений дело дошло до решающего сражения, которое состоялось близ города Мунды 17 марта 45 г. до н. э. Ожесточенная битва продолжалась до вечера. Наконец помпеянцы дрогнули и побежали. Более 30 тыс. из них пали на поле боя, в том числе Лабиен. Сексту Помпею удалось спастись, Гней бежал, но был настигнут и убит. После окончательного разгрома помпеянцев некоторое время Цезарь оставался в Испании, улаживая местные дела. В начале октября он вернулся в Рим. На этом 4-летняя гражданская война завершилась.
В Риме Цезарю были оказаны беспрецедентные почести. После Мунды сенат объявил 50-дневное благодарственное молебствие. Статуя Цезаря была поставлена среди изображений царей на Капитолии. Отныне он имел право носить одеяние триумфатора, лавровый венок на голове и пурпурные сапожки на ногах (для полного сходства с древними царями ему недоставало лишь диадемы и жезла из слоновой кости). Цезарь со всей пышностью и великолепием отпраздновал свой пятый триумф, после чего устроил два угощения для народа.
В последние месяцы 45 г. до н. э. он выступил с обширной программой разных начинаний, от похода против парфян до осушения Помптинских болот. Состав сената был расширен до 900 человек. В их числе оказались даже вольноотпущенники и выходцы из Трансальпийской Галлии, что вызвало возмущение римской общественности. Как рассказывает Светоний, «когда в сенат были приняты иноземцы, появились подметные листы с надписью: "В добрый час! Не показывать новым сенаторам дорогу в сенат!" А в народе распевали так: "Галлов Цезарь вел в триумфе, галлов Цезарь ввел в сенат. Сняв штаны, они надели тогу с пурпурной каймой"».
В декабре состоялись выборы магистратов на 44 г. до н. э. Консулами стали сам Цезарь и Антоний. Из магистратов половина была назначена всесильным диктатором.
В самом конце 45 г. до н. э. произошел курьезный эпизод, показавший всем, что традиционные республиканские процедуры окончательно превратились в фикцию. 31 декабря на Марсовом поле в трибутных комициях должны были выбирать квесторов; вдруг стало известно, что накануне умер консул 45 г. до н. э. Квинт Фабий Максим, который должен был руководить процедурой выборов. Тогда Цезарь распорядился объявить трибутные комиции центуриатными и провозгласить консулом на 10–11 часов видного цезарианца Гая Каниния Ребила. Об этом вопиющем попрании законов Цицерон спустя несколько дней с сарказмом писал своему другу Манию Курию: «Таким образом, знай, что при консуле Канинии никто не позавтракал. Однако при этом консуле не сделано ничего дурного: ведь он проявил изумительную бдительность, раз он за все свое консульство не видел сна».
В 44 г. до н. э. Цезарь в пятый раз стал консулом и был провозглашен пожизненным диктатором (dictator perpetuus). Его власть была абсолютной. Он получил право носить царское облачение, его именем приносили клятву, ему оказывали царские почести и почитали его как бога. С 63 г. до н. э. Цезарь, будучи верховным понтификом (pontifex maximus), стоял во главе всех жреческих коллегий. Теперь в его честь по всей Римской державе устраивались игры, жертвоприношения и посвящения, освящались храмы и алтари. Его изображение чеканили на монетах, родовым именем Цезаря был назван месяц квинтилий (Julius, июль). Все это свидетельствовало о формировании беспрецедентного в истории республиканского Рима «культа личности». Обожествление диктатора началось еще при его жизни (официальный апофеоз Божественного Юлия состоялся в 42 г. до н. э.).