Кроме названных сейчас лиц из белого духовенства, а также и не названных (например, ризоположенского попа Иродиона), в 50-х и 60-х годах XVII столетия в числе расколоучителей является немало и представителей монашествующей братии. Во-первых, бывший игумен московского Златоустова монастыря Феоктист. Он был ближайшим последователем Неронова и под его руководством начал писать челобитные и другие сочинения в защиту раскола и против Никонова исправления книг. Одно время он имел убежище у вятского епископа Александра, который сам разделял некоторые мнения расколоучителей о неправильном исправлении богослужебных книг. Далее бывший архимандрит муромского Спасского монастыря Антоний и бывший строитель московского Покровского монастыря Авраамий; старец того же Покровского монастыря Спиридон Потемкин, происходивший из рода смоленских дворян и находившийся в родстве с Ф.М. Ртищевым; другой Потемкин, старец Ефрем, удалившийся в пустынные леса Нижегородского края и там проповедовавший окрестным жителям о том, что уже народился антихрист, что истинная вера повреждена новопечатными книгами и так далее. Подобно ему, удалился в костромские пустыни старец Капитон, по происхождению крестьянин; человек совсем безграмотный, он тем не менее приобрел столько поклонников своей проповедью против троеперстия, что по его имени они стали называться Капитонами. Были и разные другие старцы (Симоновский Серапион, Кожезерский Боголеп Львов, Богородицкий на р. Инзе Герман и пр.), ратовавшие против исправленных книг и обрядов устно и письменно.
Но что особенно замечательно: на стороне расколоучителей оказался целый монастырь, и притом такой знаменитый и первостепенный, как Соловецкая обитель. Здесь противониконовское движение начал сам настоятель монастыря архимандрит Илья. Когда в 1657 году от новгородского митрополита сюда присланы были новонапечатанные служебники, архимандрит и ближайшие его советники сначала их спрятали; а в следующем году, когда монахи узнали о том и произошли толки, Илья созвал всю черную братию, увещевал ее постоять за православную веру и не принимать латинских новшеств. Увлеченная его единомышленниками братия согласилась с ними и подписала приговор о том, чтобы священники и дьяконы не смели служить по новопечатным книгам. Илья и его помощники после того стали распространять расколоучение по всему Поморскому краю и по многочисленным монастырским владениям. Архимандрит Илья вскоре умер. Преемник его Варфоломей, хотя и пытался отменить помянутый приговор и ввести новые книги, но безуспешно; раскол и проповедь о наступлении времени антихриста нашли очень благодарную почву среди приверженной к старине малограмотной братии и окрестного населения.
Итак, благодаря удалению Никона из Москвы и отсутствию настоящего, властного архипастыря Русской церкви в течение 8–9 лет раскол укоренялся и распространялся в Русской земле, встречая довольно незначительное противодействие со стороны духовных и светских властей. Поэтому Московский церковный собор, съехавшийся в феврале 1666 года и торжественно открытый царем в конце апреля, имел своей первой задачей приготовить меры против раскола и подвергнуть суду его главных деятелей. Не ограничиваясь карательными мерами, собор пытался действовать путем убеждения и канонических доказательств. Он обратил особое внимание на помянутые выше наиболее крупные раскольничьи сочинения, именно: челобитную попа Никиты и свиток попа Лазаря, так как эти сочинения заключали в себе главные основания раскольничьего учения, систематично и ясно изложенные. Написать опровержение на челобитную Никиты поручено было сначала Паисию Лигариду. Написанное им на латинском языке опровержение было переведено на русский иеромонахом Симеоном Полоцким. Но оно оказалось недостаточно убедительным и страдало общими местами. Тогда собор тому же Симеону Полоцкому поручил составить опровержение более подробное и, кстати, разобрать также сочинение или свиток попа Лазаря.