Престарелый Иоасаф II правил Русской церковью до 1672 года. Преемником его был новгородский митрополит Питирим, который свое кратковременное патриаршество не отметил никаким особым деянием. В 1674 году, после его кончины, на патриаршем престоле явился человек недюжинного ума и характера Иоаким. Он происходил из рода можайских дворян Савеловых; в молодых летах служил в московском войске, стоявшем на юго-западных пределах. Овдовев, он покинул военную службу и ушел в украинский Межигорский монастырь, где и постригся. Здесь на Украйне он, по-видимому, ознакомился с киевской школьной ученостью. Патриарх Никон почему-то знал монаха Иоакима, вызвал его из Межигорского монастыря и сделал строителем вновь основанной им Иверской обители на острове Валдае. Конечно, по желанию Никона он был некоторое время строителем в его Воскресенском монастыре, или Новом Иерусалиме, затем в Андреевском, по просьбе Федора Ртищева, при устроенном там братстве. По желанию царя Иоаким перешел оттуда в Новоспасский монастырь на должность келаря, а затем поставлен архимандритом знаменитого Чудова монастыря. В этом звании он принимал видное участие в деле Никона. Уважение, которое питал Алексей Михайлович к Иоакиму, сказалось особенно на дальнейшем его возвышении. Когда Питирим из Новгорода был переведен на патриарший престол, на Новгородскую митрополию был посвящен Иоаким; а когда Питирим скончался, Иоаким и теперь занял его место, имея не более пятидесяти четырех лет от роду и находясь в полном развитии своих сил. Это был первый из высших московских иерархов, если не получивший образование в киевских школах, то по крайней мере близко знакомый с ними; может быть, благодаря именно сему обстоятельству он является потом одним из духовных писателей своего времени и борцов против церковного раскола. Означенное знакомство не помешало ему (а может быть, и побудило его) проявить особую ревность по охране русского православия от сильных в то время латино-польских влияний. В отношении к подчиненному себе духовенству он был строг и с согласия освященного собора издал указы против некоторых возникавших обычаев, несогласных с прежними правилами; например, запрещал вдовым попам у кого-либо на дому исповедовать, крестить, давать молитвы роженицам и тому подобное. Запрещал также в подмосковных боярских вотчинах новопостроенные церкви освящать без присылки из Москвы соборного протопопа, ключарей и дьяконов. Свою строгость по отношению к священникам он распространил и на царского духовника, несмотря на его привилегированное положение.
В начале царствования Алексея мы видели, как его духовник благовещенский протопоп Стефан Вонифатьев смело препирался с патриархом Иосифом по вопросу о единогласии и других исправлений в церковной службе, и царь держал сторону своего духовника. А в конце царствования видим распрю преемника сего последнего протопопа Андрея Савиновича Постникова с патриархом Иоакимом. Впрочем, эта распря имела чисто личные поводы. Очевидно, духовник зазнался и показывал строптивость в отношении патриарха. Последний обвинил его не только в неповиновении, но и в зазорном поведении, а именно в мздоимстве, пьянстве и даже прелюбодеянии, за что хотел его судить. Андрей Савинович не смирялся. Но Иоаким характером не походил на Иосифа; он велел взять протопопа и посадить на цепь для смирения. Это было в первых числах ноября 1674 года. Государь находился за городом, в селе Преображенском. Духовник не поддался патриаршему велению и послал своего сына стольника Ивана Постникова к царю с мольбой о заступничестве. Алексей Михайлович на другой день воротился в столицу и призвал к себе патриарха; но тщетно просил его за своего духовника. Иоаким, обвиняя Андрея в названных выше деяниях, запретил ему священнодействовать, благословлять и исповедовать, пока его дело не будет рассмотрено на соборе. Недели две спустя царь отправился опять в село Преображенское, и, опасаясь, чтобы патриарх не прибег к насилию, приказал поставить на дворе у своего духовника караул из 20 стрельцов, которые бы никого к нему не допускали без особого указу. Прошло еще около месяца. За несколько дней до рождественского праздника царь опять призвал патриарха и едва наконец упросил, чтобы тот простил протопопа Андрея и разрешил ему священнодействовать. Тогда протопоп, по приказу государя, снова «в верх въехал», то есть стал отправлять свои обязанности во дворце. Так Алексей Михайлович умел чтить и благодетельствовать приближенных к нему людей.
Посмотрим, кто были самые крупные сотрудники государя на военном и гражданском поприще, кроме известного временщика Б.И. Морозова, о котором достаточно говорилось выше.