Однако Смута не успокаивается, охватывая юго-западные уезды. Один из приспешников Лжедмитрия I, князь Шаховской (воевода Путивля), уверял, будто «царь Дмитрий» не погиб, а спасся и скрывается до поры до времени. На арену борьбы вышли «социальные низы», возглавляемые полководцем Иваном Болотниковым, человеком по-своему честным и простодушным. В советской историографии его прославят как лидера «крестьянской войны». Но правильнее её называть гражданской войной, потому что в ней участвовали не только крестьяне и холопы, но и казаки (северские, терские, волжские и запорожские), дворяне с их лидерами (рязанский – Прокопий Ляпунов, тульский – Истома Пашков и северский – Андрей Телятников) и даже наёмное войско с артиллерией. По национальному составу все наёмные армии того времени представляли собой пёструю массу казаков, татар, литовцев, шведов, поляков и прочих «немцев». Иван Болотников двинулся от Кром на Калугу и далее на Москву, чтобы свергнуть «незаконного» царя Василия. С победами и поражениями, разделываясь с дворянами и пополняя ряды «царевичами» вроде Ильи Горчакова, он берёт Тулу. Но в результате осады, вспыхнувшего голода и затопления города повстанцы вступают в переговоры с царём и, вопреки его обещаниям о помиловании, Болотникова сначала ослепляют, а потом «утопляют». Воеводу Шаховского насильно постригают в монахи.
«Остатки воров» примыкают к уже появившемуся на свет Лжедмитрию II. Усиленный отрядами литовцев и казаков, он приходит и укрепляется в Тушино. Его «признают» спасшаяся во время погрома и бежавшая из Москвы «царица» Марина Мнишек и римский папа. Ему присягают Псков, Суздаль, Астрахань, Кострома, Ярославль и множество других городов. Но реально власть под Москвой принадлежит воеводам польских отрядов Ружинскому, Лисовскому и Яну Сапеге. Казаки рыскают по окрестностям, грабя местных крестьян. «Воровская столица» Тушино представляла собой в ту пору необычайное зрелище. На вершине холма стояла просторная рубленая изба, служившая царской резиденцией. За «дворцом» располагались здания приказов и Боярской думы, жилища русской знати и шатры польских гусар. Остальная часть Тушина состояла из наспех выстроенных шалашей и палаток, буквально утопавших в грязи.
В мае 1608 года в Тушино объявился Филарет, которого будто бы привезли силой. Но Лжедмитрий II пожаловал Романова в патриархи. «Филарет, – говорил Авраамий Палицын, – был разумен, не склонялся ни направо, ни налево». Он отправлял богослужение, поминал Тушинского вора Дмитрием, в то время как за неприятие самозванца пострадали епископ Суздальский Галактион и епископ Коломенский Иосиф, принял мученическую смерть архиепископ Тверской Феоктист. А когда дела самозванца ухудшились, Филарет стал одним из инициаторов приглашения королевича Владислава на московский престол. Тушинскую Боярскую думу возглавлял князь Дмитрий Трубецкой – будущий герой освобождения Москвы от поляков. В ней заседали и бывшие приближённые Лжедмитрия I, и родственники Филарета. Осознавая, что мятежников вскармливает Речь Посполитая, Василий Шуйский заключает против неё союз со Швецией, и Карл IX посылает на подмогу Москве шведский отряд под начальством генерала Делагарди. Польский король Сигизмунд III отвечает разрывом с Москвой и осаждает Смоленск.
Тушинские бояре во главе с Михаилом Салтыковым составляют «посольство» для переговоров с Сигизмундом на предмет возведения на московский престол его сына королевича Владислава. Мало того, что они выступают как представители государства, но ещё и сочиняют проект договора, где оговаривают условия. Договор от 4 февраля 1610 года – это чудесный документ, смахивающий по содержанию на конституцию. (Кстати, он сочинён за сто лет до такого же «чудесного» документа Ф. Орлика, который украинские самостийники называют сегодня первой конституцией в Европе.) В нём сошлись благодушные помыслы о защите от произвола монаршей власти, права сословий и даже своеобразный принцип разделения властей. Все это – архаичная копия с «демократических свобод» Речи Посполитой.