В то время один распутный юноша взял одну монахиню-деву, и они пошли, чтобы исполнить желания плоти. Этот поступок в высшей степени опечалил и огорчил святого. Когда он сидел с клириками, один из них рассказал об этой монахине, и все прокляли того юношу, говоря, что он погубил не только свою, но и ее душу. Святой же стал обвинять клириков такими словами: “Умолкните, дети мои, и не согрешайте осуждением, потому что не знаете, пребывают ли они во грехе, или обратились на покаяние. Послушайте случай, бывший с одним монахом праведной жизни, о котором я вычитал в книге. Когда этот монах шел в Тир, то по дороге ему встретилась одна блудница, по имени Порфирия, которая сказала: «Отче, ради любви Христовой спаси меня, как Господь спас блудницу, и исторгни из греха». Авва ответил: «Следуй за мной». Он взял ее и хотел отвести в монастырь, но люди в том городе стали их осуждать. Через некоторое время Порфирия нашла на дороге брошенного младенца, и, пожалев, взяла его на воспитание. Видя это, жители Тира подумали, что это ее ребенок от монаха, и говорили ей: «Какого хорошенького ребеночка ты родила монаху». Безумные разнесли эту весть повсюду, клятвенно заверяя, что младенец видом своим во всем похож на монаха. Спустя много лет, чувствуя приближение своей кончины, монах сказал Порфирии: «Пойдем в Тир, Пелагия (таким было ее монашеское имя), потому что у нас там дело». Они вошли в город, взяв с собой и воспитываемого ими ребенка. Монах тот заболел и слег в том же монастыре, где и был прежде. Туда собралось множество народа, чтобы посмотреть на него. Он попросил принести горящие угли и, положив себе на грудь, держал так долгое время, причем ни тело его, ни одежда нисколько не пострадали. После этого, обращаясь ко всем, он произнес: «Благословен Бог, сохранивший купину неопалимой в огне. Он — Свидетель верный, что как этот огонь нисколько не тронул мою одежду, так и я никогда не знал женщину по плоти». Когда все услышали и увидели такое чудо, они испытали трепет и прославили Бога, Который явно прославляет тех, кто работает Ему втайне. А преподобный с этими словами предал душу свою в руки Божии. Многие другие блудницы по примеру Пелагии отреклись от мира и, пойдя с ней, спаслись покаянием. Поэтому говорю вам, дети мои, не осуждайте больше никого, ибо часто мы видим внешний грех брата, а его тайное покаяние не видим. Один Бог видит то, что сокрыто в сердце человека”. Получив такую пользу, клирики перестали злословить и осуждать.
Однажды в Александрии началась эпидемия чумы, и святой сам навещал больных и поддерживал находящихся при последнем издыхании, закрывал им глаза и погребал умерших, говоря присутствующим, что получает большую пользу тот, кто взирает на надгробия, размышляя о смерти. Иоанн совершал литургии и панихиды по умершим, а также и других увещавал поступать подобным же образом, потому что литургии и панихиды приносят большую пользу не только умершим, но и живым. В подтверждение сказанного патриарх приводил следующий пример. Однажды персы взяли в плен одного киприота. А товарищи его, вернувшись на родину, передали родственникам, что он погиб, и они его похоронили. Однако они ошиблись, потому что это был не он, а похожий на него человек. Его же самого, закованного в железо, увели персы. Родственники, по обычаю, стали совершать панихиды, а через четыре года пленник возвратился к себе домой. Отчаявшиеся увидеть его родственники очень обрадовались и сказали: «Мы были уверены, что ты погиб, и служили по тебе трижды в год литургии: на Пятидесятницу, на Богоявление и на Пасху». Удивившись, тот стал уверять их с клятвой, что в эти самые дни ему являлся муж, прекрасный видом и сиявший сильнее солнца. Он снимал с него цепи и три раза в год водил по тем местам, где он хотел быть, так что никто его не узнавал, и он смог сбежать. «На этом примере, — говорил святой, — воистину уверуем в то, что от литургий и молитв священников все получают большую пользу».