После этого в РККА развернулась широкая кампания по критике «оппозиционеров». Она отличалась тем, что основной огонь был сосредоточен на «ошибочности» и «политической вредности» резолюций ВПАТ и БВО. Основная целевая установка, исходящая от ЦК партии, по проведению указанной кампании была выполнена. Командиры и политработники Красной Армии на партийных собраниях и конференциях частей, соединений и округов осудили позиции партколлектива Военно-политической академии и политработников Белорусского военного округа, указали на «тенденциозность» принятых ими резолюций, содержащуюся в них политически ошибочную оценку состояния армии и в особенности начсостава, элементы прямого недоверия руководству Красной Армии.
Такое «единодушие» объясняется тем, что большинство командиров и политработников не знали содержания резолюций, которые обсуждались, действовали прежде всего по команде «осудить». Напротив, из текстов резолюций извлекались отдельные положения, которые истолковывались произвольно и служили основанием для огульной критики.
Тем, кто хоть в какой-то мере разделял взгляды «толмачевцев» и политработников Белорусского военного округа, Политуправление РККА предложило написать письма с покаянием. Эти письма широко публиковались в центральных и окружных военных изданиях, а их авторы полностью признавали свои ошибки, клялись в верности руководству Красной Армии, восхищались «твердостью» вождей в борьбе с внутренними врагами.
7 декабря 1928 г. газета «Красная звезда» напечатала открытое письмо группы бывших «толмачевцев», отказавшихся от своих прежних позиций и призывавших других последовать их примеру. В Военно-политической академии была спешно проведена чистка. С помощью кампании по перевыборам президиумов ячеек и бюро ячейки ВКП(б) академии, проходившей в декабре 1928 г., было решено добиваться создания таких руководящих органов, которые целиком обеспечили бы проведение в академии линии армейского партийного руководства. Партийное собрание академии, состоявшееся 5 января 1929 г., приняло по докладу А.С. Бубнова резолюцию, осуждающую позицию, выраженную 15 марта 1928 г., как и решение совещания высшего политсостава Белорусского военного округа от 23 мая 1928 г.
Причины всех этих событий кроются прежде всего в обстановке, которая начала складываться в стране, партии и армии в конце 1920-х гг. Именно в это время И.В. Сталин и его ближайшее окружение резко усиливают борьбу с любым инакомыслием. Начинает проводиться линия на форсированное строительство социализма, жесткое выполнение принятых решений во что бы ни стало. Постепенно утверждается курс на недопущение критики руководства.
К тому же в рядах политработников сохранялось достаточно много сторонников Л.Д. Троцкого, которых миновали чистки предшествующих лет. Естественно, что в такой обстановке ни К.Е. Ворошилов, ни А.С. Бубнов не намерены были прощать критику, прозвучавшую в адрес высшего руководства военного ведомства.
В 1928 г. были освобождены от занимаемых должностей заместитель начальника Политуправления РККА И.Е. Славин, начальник политуправления Белорусского военного округа М.М. Ланда, начальник Военно-политической академии им. Н.Г. Толмачева Я.Л. Берман, многие политработники соединений и частей БВО, преподаватели академии. Всего по этому делу было привлечено к ответственности 73 человека. Отстранение от занимаемых должностей, перемещение по службе, как правило, со значительным должностным понижением, естественно, надо было чем-то мотивировать. И мотив был найден: существование и раскрытие «оппозиции» как некой организации, которая якобы выступила против курса партии на введение единоначалия в армии.
Через 10 лет была дана установка пересмотреть с «новых позиций» дела давно минувших лет и выявить всех скрытых противников режима. Только за период с мая по декабрь 1937 г. партийная комиссия Военно-политической академии заслушала 157 персональных дел работников ВПАТ. Большинство из них были исключены из партии, а некоторые сразу же были арестованы как «враги народа».
Тем не менее резолюции «толмачевцев» и части высшего политсостава БВО способствовали усилению работы по решению проблем, связанных с осуществлением единоначалия в РККА. В последующие годы темпы практического осуществления единоначалия не сбавлялись. Несмотря на то, что с самого начала осуществление единоначалия столкнулось с рядом проблем, к концу 1928 г. был сделан ряд шагов по их разрешению. Но главного препятствия на пути к осуществлению полного единоначалия в период военной реформы так и не удалось преодолеть. Оно заключалось в продолжении существования самого института военных комиссаров и помощников по политической работе.