Во Франции многие члены королевского правительства и дворянства стали гугенотами, составив мощную политическую и религиозную силу. С 1562 г. между гугенотами и католиками разгорелась борьба, известная как Французские религиозные войны. Делу короны помогло возникновение антигугенотских чувств во Франции, которое достигло кульминации во время Варфоломеевской ночи в 1572 г., когда около 30 000 гугенотов были зарезаны. Нантский эдикт 1598 г., положил конец войнам, гарантировал религиозную терпимость во Франции, но подтвердил, что гугеноты являются религиозным меньшинством в католической стране.
Послание Лютера было услышано и принято реформаторами церкви в других странах Европы. В Швейцарии Ульрих Цвингли основал движение реформаторов, которое отличалось от лютеранства пониманием евхаристии. Более радикальная форма протестантизма была принята анабаптистами, которые отказались от принятия присяги, уплаты десятины, массовых крещений или крещения детей. Однако самой влиятельной фигурой Реформации после Лютера был Кальвин, бескомпромиссный подход которого к религиозной жизни преобладал в протестантских движениях во Франции (гугеноты) к 1540 гг. и в Нидерландах в 1560-х гг. Действительно, кальвинизм был движущей силой голландского восстания против испанского правления (1566–1648). Он был официально принят в Швейцарии (1541), Шотландии (1560-е), и трех германских государствах (1600-е). В Англии Постановление Елизаветы 11559 г. наконец утвердило протестантизм как национальную религию после кратковременного возобновления ее сестрой, Марией, власти католицизма (1553–1558). К началу XVII в. почти 40 % населения Европы было протестантским.
Очень рано Католическая церковь поняла необходимость согласованного ответа на угрозы протестантизма. Ответный удар, названный позднее Контрреформацией, был одобрен с принятием папой ордена иезуитов (1540), который был предназначен для молитвы и милосердных дел, чтобы возглавить кампанию по реформированию церкви изнутри. За этим последовал Совет в Тренте (1545–1563), который стандартизировал мессу во всей церкви и ввел различные церковные реформы в надежде заставить протестантов-«еретиков» вернуться к истинной вере.
Но Контрреформация была больше, чем форма борьбы с протестантизмом. При Филиппе II Испанском Церковь одобрила желание монарха начать военные действия против стран, которые покинули веру. Филипп подавил восстание морисков (мавров, которые перешли в христианство) в 1568 г. Он попытался подавить голландское восстание, захватив большую часть Южных Нидерландов. В 1587 г., когда Елизавета I казнила свою кузину-католичку Марию, королеву шотландцев, положив конец надеждам католиков вернуть веру при посредстве Марии, Филипп II ответил, послав большой флот для захвата Англии в 1588 г. В этом случае он проиграл: его Армада потерпела поражение не только из-за неблагоприятной погоды, но и благодаря удачным действиям англо-голландского флота.
Европа во времена Тридцатилетней войны
1618–1648