По предложению Б.Н. Ельцина были созданы согласительные комиссии, которые распределили пропорционально количеству мест, полученных на выборах, все руководящие посты в Верховном Совете и на Съезде народных депутатов РСФСР. Это позволило на время ослабить внутренние противоречия в депутатском корпусе. Подобным компромиссным путем формировалось и новое правительство России. Председателем Совета министров РСФСР съезд назначил И.С. Силаева, бывшего до этого заместителем Председателя Совета министров СССР, председателем Бюро Совета министров СССР по машиностроению. Его заместителем стал Г.А. Явлинский, предложивший радикальную программу реформирования экономики. Кандидатуры министров также были компромиссными.
С начала работы съезда и созданного им Верховного Совета РСФСР в России начались политические реформы. В Конституцию РСФСР было внесено положение, что «все политические партии... действуют в рамках Конституции СССР, Конституции РСФСР и Конституций автономных республик». КПСС, таким образом, устранялась из государственного управления, уравнивалась с иными партиями и общественными организациями.
В предпоследний день работы XXVIII съезда КПСС Б.Н. Ельцин, будучи депутатом съезда, заявил о своем выходе из КПСС, сказав, что «как глава высшей законодательной власти республики, я должен подчиняться воле народа и его полномочных представителей», и подтвердил свою готовность сотрудничать со всеми партиями.
Сделав это заявление, Б.Н. Ельцин демонстративно покинул зал заседания. Поступок Б.Н. Ельцина стал свидетельством начала принципиально нового явления — фактического устранения КПСС из высших звеньев государственной власти и управления в республике.
Начало подготовки радикальной экономической реформы. «Программа 500 дней».
Летом 1990 г. в стране началась интенсивная работа по подготовке к проведению экономической реформы. Концепция быстрого реформирования экономики страны встретила поддержку значительной части депутатского корпуса России.Необходимость реформы осознавалась и союзным, и республиканским руководством. Приметами глубокого кризиса было снижение объемов производства, рост инфляционных тенденций, стремительное сокращение золотовалютных ресурсов страны. Не хватало продовольствия, вспыхивали табачные и водочные бунты. В ходе подготовки к экономической реформе наметилось сближение союзного и нового российского руководства. В июле 1990 г. состоялась пятичасовая встреча М.С. Горбачева и Б.Н. Ельцина, пришедших к согласию о необходимости проводить единую экономическую политику в СССР и в РСФСР. И тот и другой в полной мере понимали срочность решения экономических задач. Не было сомнения и в том, что для этого необходимо включить рыночные механизмы.
Договоренности Б.Н. Ельцина и М.С. Горбачева были закреплены специальным распоряжением Президента СССР от 2 августа 1990 г. «О подготовке концепции союзной программы перехода на рыночную экономику как основы Союзного договора». Для разработки этой концепции была создана комиссия, куда вошли экономисты-«рыночники» С.С. Шаталин, Н. Петраков, Л.И. Абалкин, Г.А. Явлинский, А.П. Вавилов, Л.М. Григорьев, М.М. Задорнов, В.А. Мартынов, В.М. Мащиц, А.Ю. Михайлов, Б.Г. Федоров, Н.П. Шмелев и Е.Г. Ясин. В комиссию входили также полномочные представители правительств союзных республик. Проект концепции перехода к рынку надо было представить к 1 сентября 1990 г.
Вице-премьер российского правительства Г.А. Явлинский предложил программу «500 дней», предусматривавшую поэтапный переход экономики всей страны на рыночные отношения, а также разработку правовых и нормативных актов для такого перехода. Идея скорого перехода к экономическим реформам в рамках всех союзных республик, высказывавших намерение остаться в СССР, получила поддержку у руководителей этих республик.
Но это согласие сохранялось недолго. Вскоре выяснилось, что среди разработчиков реформ нет единства. По мнению академика Л.И. Абалкина, бывшего вице-премьером союзного правительства, следовало сначала стабилизировать союзную экономику и лишь потом начинать ее радикальное реформирование. Ему возражали академик С.С. Шаталин и Г.А. Явлинский. Они доказывали, что в условиях продолжающегося падения экономики нужны срочные, неотложные меры по ее реформированию. Второй уровень противоречий касался политических следствий реформы. М.С. Горбачева убеждали, что российское руководство, ставшее инициатором реформы, перехватывает политическую инициативу.
М.С. Горбачев предложил не лишенный элегантности план, который должен был быть поддержан Верховным Советом СССР, — объединить программы Г.А. Явлинского и Л.И. Абалкина, против чего возражал Б.Н. Ельцин: «Это невозможно. Совершенно другие принципы заложены».