Вскоре, по просьбе князя Острожского, был переведён в находившийся в его владениях Дубенский Крестовоздвиженский монастырь, где стал настоятелем и управлял монастырём более 20 лет в обстановке нараставших гонений на Православие со стороны римо-католиков и униатов. Много писал в защиту Православия.
В начале XVII века преподобный удалился на Почаевскую гору и поселился в пещере неподалёку от древней Успенской обители. Полюбив святого отшельника, иноки избрали его своим игуменом.
В 1628 году принимал участие в Киевском Соборе, осудившим унию и постановившем твёрдо стоять за Православие. Под постановлением этим есть подпись: «Иоанн Железо, игумен Почаевский».
Иногда полностью затворялся в пещере на три дня или на це́лую неделю. Иисусова молитва была непрестанным деланием его кроткого сердца. По свидетельству ученика и составителя жития преподобного Иова Досифея, однажды во время молитвы преподобного пещеру осиял небесный свет.
Скончался 28 октября 1651 года после пятидесятилетнего управления Почаевской обителью, прожив чуть более 100 лет.
Молитвы
О преподобный отче Иов, иноков трудолюбивого жития богомудрый наставник, образ кротости и воздержания, чистоты и целомудрия, братолюбия и нищелюбия, терпения и бдения; от ранней юности до поздней старости неутомимый подвижник, веры православной великий ревнитель и непобедимый защитник, земли Волынской и Галицкой светило богосветлое и святой Почаевской обители непобедимый защитник! Призри оком милосердия твоего на нас недостойных чад твоих, к тебе усердно во все дни прибегающих и на боголюбивых людей сих, пред твоими духоносными и многоцелебными мощами собравшихся и благоговейно к тем припадающих, и испроси заступничеством твоим к Всевышнему Владыке им и нам всё, что к жизни и благочестию, полезно и благопотребно: болящим исцеление, малодушным ободрение, скорбящим утешение, за обиженных заступничество, немощным подкрепление и падших восстановление, всем всё, благодатью тебе от Бога данною, даруй каждому по его нужде и потребности, во спасение души и во здравие телу. Вознеси, угодник Божий, всемощную молитву твою, да будет в стране нашей всегда мир и тишина, благочестие и благоденствие, в судах правда и милость, в советах мудрость и благое преуспевание, да утверждается же во благих людях верность, в злых же страх и боязнь, чтобы прекратить им делать зло и начать творить добро, да так в стране нашей Царство Христово будет расти и множиться и да прославится в нём Бог, дивный во Святых Своих: Ему же единому подобает всякая слава, честь и поклонение Отцу, и Сыну, и Святому Духу, ныне и всегда, и во веки веков. Аминь.
Патриарх Афанасий III (Константинопольский) († 1653)
Патриа́рх Афана́сий III (в мiру Алексий Пателла́рий, греч. Αλέξιος Πατελλάριος; в России известен как святитель Афанасий Царегра́дский (сидящий), Лу́бенский чудотворец либо Афанасий Харьковский; 1597, Ретимнон, Крит – 5 апреля 1654, Мгарский монастырь, Лубенский полк) – Константинопольский Патриарх (1634, 1635 и 1652); ранее – митрополит Фессалоникийский; участник книжной справы, предпринятой Московским Патриархом Никоном в 1653 году.
Святой Русской Церкви; память – 2 (15) мая, в день памяти соимённого ему Афанасия Великого и в Соборе Афонских преподобных (второе воскресенье по Пятидесятнице).
Происходил из знатного рода, связанного с династией Палеологов. До 26 лет жил на Крите в монастыре Аркади, бывшем под властью венецианцев; получил образование в монастыре Аркадиу.
В 1631 году был рукоположён в митрополита Фессалоникийского; пользовался покровительством своего земляка Патриарха Кирилла Лукариса.
В начале 1634 года в Фанаре вновь (в третий раз) сформировалась принципиальная оппозиция Патриарху Кириллу Лукарису в связи с публикацией в марте 1629 года его
Уже чрез несколько дней уступил престол возвратившемуся из ссылки Кириллу Лукарису, ввиду того, что голландское посольство сумело выплатить Порте сумму в 70 тысяч талеров за восстановление (четвёртое) на престоле Лукариса.