В зависимости от масштабов десантных операций организация сил, в деталях, имела некоторые особенности, но в целом принципы ее оставались неизменными. Обычно десант состоял из: а) десантных войск; б) отрядов транспортов (по числу пунктов высадки), если десантные войска высаживались на мелких плавсредствах (катера МО, бронекатера, сейнера) – специальные отряды высадочных средств не формировались, так как высадка десанта производилась непосредственно с этих же средств; в) сил охранения; г) отрядов корабельной поддержки (по числу районов высадки), в некоторых десантных операциях одни и те же корабли использовались одновременно как десантные транспорты и как корабли поддержки (например, в Керченско-Феодосийской десантной операции); д) сил прикрытия, которые обычно состояли из: маневренных соединений надводного флота, соединений подводных лодок, соединений ВВС, иногда из артиллерии, установленной на берегу (Новороссийская, Керченско-Феодосийская, Керченско-Эльтигенская и Аккерманская десантные операции).[423]
Исследование вопросов организации командования силами в операциях показало, что командующему десантной операцией подчинялись: командиры сил высадки, отвечавшие за организацию посадки, переход морем и высадку войск десанта в назначенных районах; командиры морского и воздушного (танкового) десантов, отвечавшие за выполнение десантами задач на берегу; авиационный начальник, командующий соединениями (частями) авиации, выделенными для обеспечения высадки десанта; командиры соединений (частей) корабельной, береговой и полевой артиллерии, осуществлявших подавление противодесантной обороны противника; командиры соединений и частей войск противовоздушной обороны, выделенных для прикрытия сил высадки от ударов противника с воздуха в пунктах посадки, на переходе морем и в районах высадки; через заместителя – командующего флотом: командиры соединений подводных лодок, морской авиации, надводных кораблей, прикрывавших переход морем и высадку морского десанта от ударов противника с моря. Опыт войны подтверждает необходимость подчинения всех этих группировок командующему силами в операции. Так, при высадке десантов в Тулоксинской и Лане-Мехикоормской десантных операциях, а также на острова Бьеркского архипелага и Выборгского залива командующему силами в десантной операции не подчинялась авиация, а в двух последних случаях, кроме того, и береговая артиллерия, то есть силы, предназначенные для подавления противодесантной обороны противника.[424]
Это приводило к срыву запланированного взаимодействия, а иногда и к нанесению ударов авиацией по своим войскам. Авиация действовала лишь по установленным ранее объектам и срокам. Гибкое управление ею было невозможным.Командир десантных войск подчинялся командующему операцией до захвата плацдарма на берегу в соответствии с планом операции. Отвечая за решение десантом задач на берегу, он высаживался на главном направлении высадки. Командир высадки отвечал за посадку, переход морем и высадку войск десанта в назначенном районе. Командирами высадки назначались командиры военно-морских баз или командир одного из соединений кораблей, участвовавших в высадке десанта.
Командиру высадки подчинялись: командиры десантных отрядов, отвечавшие за готовность транспортов и десантных кораблей отряда, своевременный подход их к пунктам посадки, соблюдение установленного порядка размещения войск и грузов на кораблях, своевременность и безопасность перехода морем десантно-транспортных средств с войсками десанта, а также за высадку десантных войск на берег; командир отряда кораблей артиллерийской поддержки (ОКАП), отвечавший за готовность кораблей и своевременное выполнение задач, возложенных на ОКАП, на переходе десанта морем и в бою за высадку; командир базы высадки (если она создавалась), отвечавший за разгрузку техники и груза десанта в пунктах высадки, распределение, охрану и отправку грузов десанта по назначению; командир охраны водного района (ОВР) высадки (если она создавалась), организовывавший противолодочную (ПЛО), противоминную (ПМО) и противокатерную (ПКО) оборону, а также рассредоточенную стоянку и режим движения кораблей и судов в районе высадки; командиры обеспечивающих групп и отрядов (гидрографической группы, маневренного спасательного отряда, десантного медицинского отряда, групп разграждения и др.); командир десантных войск на период посадки, перехода морем и высадки. Он выходил из подчинения командира высадки после высадки на берег главных сил десанта, а в отдельных случаях – их первого эшелона.