23 сентября 2005 года советник Президента В. В. Путина по экономическим вопросам и член Национального банковского совета А. Н. Илларионов в интервью «Российской газете» заявил о том, что «страна меняет экономический курс». «Поворот, – по его словам, – происходит не только в экономической политике, но и в национальной экономической дискуссии и в господствующем экономическом мышлении. Направление движения сомнений не вызывает. Поворот совершается в сторону государственного капитализма, интервенционизма и популизма. Это принципиально иная модель экономического развития, чем та, создание которой было официально провозглашено в 2000 году».
27 декабря 2005 года Илларионов подал в отставку. На брифинге перед журналистами он сообщил, что больше не может свободно выражать свое мнение, поскольку в России за шесть лет президентства В. В. Путина произошла смена политического режима.
Планы правительства по упорядочению системы госбанков долгое время оставались не ясными. Известно, что В. В. Геращенко выступал за поэтапную приватизацию Внешторгбанка. На первом этапе Центральный банк намеревался продать до 20 % акций Внешторгбанка (ВТБ) Европейскому банку реконструкции и развития (ЕБРР), а 10–15 % – Правительству.
В кабинете М. М. Касьянова вынашивались планы объединения ВТБ, «Росэксимбанка» и Внешэкономбанка СССР в один банк со стопроцентным участием в его капитале Правительства («Внешэкономбанк России») и создания Долгового агентства РФ. Затем в правительственную концепцию начали вносить изменения: было решено Внешэкономбанк СССР (ВЭБ) и Внешторгбанк (ВТБ) не объединять, а часть активов ВЭБа («коммерческую часть») перевести во ВТБ. На базе же «Росэксима» планировалось создать Агентство по поддержке экспорта, которое частично контролировал бы Внешэкономбанк СССР.
В июне 2002 года Минфин и Центробанк окончательно согласовали условия передачи Правительству принадлежавших Центральному банку акций Внешторгбанка (ВТБ).
В январе 2003 года ВЭБ выкупил 95 % акций «Росэксимбанка», и, по выражению премьера М. М. Касьянова, ВЭБ и «Росэксимбанк» стали «братом и сестрой». Внешэкономбанк СССР (ВЭБ) продолжал выполнять функции агента Правительства по обслуживанию внешнего долга, а с 2004 года – еще и функции государственной управляющей компании (ГУК) по доверительному управлению средствами пенсионных накоплений «молчунов» – граждан, не определившихся с выбором негосударственного пенсионного фонда.
В начале марта 2005 года Внешторгбанк (ВТБ) приобрел у компании «Петровский трейд хаус» блокирующий пакет акций крупнейшего на Северо-Западе коммерческого банка – ОАО «Промышленно-строительный банк» (ПСБ) с активами порядка 100 млрд. рублей. Приобретение пакета акций ПСБ в размере 25 % + 1 акция было первым этапом сделки между банками, одобренной Федеральной антимонопольной службой (ФАС). В сентябре 2004 года кредитные организации подписали меморандум, предполагающий возможность выкупа ВТБ контрольного пакета акций ПСБ. Согласно документу, вторая сделка должна была состояться в декабре 2005 года. Миноритарными акционерам ПСБ были предложены условия выкупа их акций или обмена их на акции Внешторгбанка.
29 марта 2005 года Внешторгбанк (ВТБ) объявил о том, что его наблюдательный совет утвердил концепцию создания специализированного розничного банка – на базе приобретенного во время летнего кризиса 2004 года «Гута-банка». Новая структура второго по величине государственного банка выглядела следующим образом: во главе его стоял материнский корпоративный банк – Внешторгбанк, который контролировал свой специализированный розничный банк и ряд дочерних банков в России, СНГ и Европе.
Помимо контроля над своими дочерними структурами на материнский банк возлагались функции координатора их бизнеса, а также финансовое управление и управление рисками своих «дочек». В «Гута-банк» переходил весь розничный бизнес Внешторгбанка: обслуживание физических лиц и малых предприятий с годовой выручкой до $3 млн. Все корпоративные клиенты «Гута-банка» переводились на расчетное и кредитное обслуживание в ВТБ. География присутствия «Гута-банка» расширялась с 24 до 40 регионов. Рост бизнеса специализированного розничного банка основывался на дополнительных инвестициях (от 17 до 21 млрд. рублей) в развитие его инфраструктуры со стороны акционеров. Сам «Гута – банк» предполагалось переименовать, чтобы исправить его подпорченную летним кризисом 2004 года репутацию.
В конце 2004 года Правительство приняло решение об увеличении уставного капитал Внешторгбанка (ВТБ) на $1,3 млрд. Затем последовал ряд приобретений в СНГ. В Европе Внешторгбанк стал основным акционером в капитале росзагранбанков, создал совместный банк во Вьетнаме, а также открыл банк в Анголе и финансовую компанию в Намибии.