Как известно, в наследство от матушки-природы Петербургу достался удручающий своим однообразием плоский географический ландшафт. Пулковские и Шуваловские высоты, Дудорова и Поклонная горы не в счёт. Во-первых, их спуски и подъёмы настолько пологи, что на всём своём протяжении остаются почти незаметными для глаза. Во-вторых, в начале XVIII века эти высоты находились на далёких рубежах ещё только начинавшегося Петербурга и своим присутствием в окружающем пространстве лишь подчеркивали равнинный характер всей остальной местности. Однако эту досадную географическую особенность многоопытная природа щедро компенсировала широко разветвлённой уникальной сетью многочисленных больших и малых рек, малоприметных ручьев и ручейков, рукавов и протоков, в голубых зеркалах которых низкое северное небо становится неожиданно высоким, а пологие берега удивительным образом достают до облаков. По процентному соотношению водной поверхности и суши Петербург стоит на одном из первых мест в мире. Даже в наше время, когда город в своём развитии давно перешагнул границы собственно невской дельты, вода занимает десять процентов его территории. Чтобы острее почувствовать масштаб сравнения, напомним, что площадь дельты Невы составляет 83 квадратных километра.
Стремительное строительство Петербурга внесло серьёзные коррективы в сложившуюся к тому времени естественную структуру дельты Невы. Осушение болот, строительная и хозяйственная деятельность, военные нужды требовали активного вмешательства в природную среду. Засыпались одни русла рек и прокладывались другие. Прорывались каналы и объединялись малые ручьи и ручейки. Удлинялись и укорачивались тысячелетние русла водных потоков. Спрямлялись извилистые берега. На географической карте Петербурга появлялись новые гидронимы: Крюков канал, Кронверкский проток, Зимняя канавка, Лебяжий канал, Обводный канал и многие другие имена гидрографических сооружений, властно вписанных человеком в древнюю естественную структуру дельты Невы.
Вместе с этими изменениями за 300 лет человеческой деятельности с топонимической карты Петербурга навсегда исчезли многие исторические названия. В конце XIX – начале XX веков засыпали реки Ольховку, Чернавку, Емельяновку, Таракановку и многие другие. Прекратили свое существование Лиговский ручей и многочисленные мелкие протоки между островами. Прорывались, а затем по разным причинам засыпались каналы. В 1721 году вошёл в эксплуатацию и в 1969 году окончательно засыпан за ненадобностью Лиговский канал. Та же участь постигла более молодой Введенский канал, застойная вода которого долгое время не давала покоя отцам города. Канал просуществовал с 1804 по 1971 год. Ныне не существуют каналы в Петропавловской крепости и каналы вдоль линий Васильевского острова. Исчезли каналы на территории Адмиралтейства и Красный канал вдоль западной границы Марсова поля. Порой менялся даже статус водных потоков. Так, углублённые и спрямлённые речки Кривуша и Волковка превратились соответственно в Екатерининский (ныне – канал Грибоедова) и Волковский каналы. Список подобных утрат и изменений можно продолжать и продолжать.
Не осталась неизменной даже прибрежная часть Финского залива, куда сбрасывает свои воды Нева. В основном эти изменения произошли за счёт сооружения Морского канала, намывки новых территорий в районах Лахты и Васильевского острова и строительства комплекса защитных сооружений от наводнений – Дамбы.
Трудно переоценить роль и значение рек в жизни Петербурга первых лет его существования. Нева стала главной транспортной магистралью города, дорогой, по которой в Петербург прибывали купеческие торговые корабли с товарами и иностранными путешественниками. Вдоль рек и каналов возникали промышленные предприятия, поскольку вода была самым дешевым способом перемещения грузов и готовой продукции. Реки были естественными пожарными водохранилищами в борьбе с огненной стихией. В условиях Северной войны, которая закончилась только в 1721 году, реки представляли собой непреодолимые препятствия при возможном нападении противника и создавали достаточные запасы пресной воды в случае возможной осады города. Они являлись неограниченными источниками питьевой и технической воды. И наконец, создание новых русел рек и каналов в то время – единственный способ осушения болотистой почвы.