Постановлением ЦК КПСС и Совета Министров СССР от 10 июня 1971 года головной комплекс А‑35 приняли на вооружение и 1 сентября поставили на боевое дежурство.
В дальнейшем Г. В. Кисунько, учитывая опыт проведенных в начале 1960‑х годов испытаний «Операции К» и помехового воздействия ядерных взрывов, обосновал ряд первоочередных технических решений по модернизации А‑35 для придания ей способности поражения хотя бы одной сложной баллистической цели. Предложенный им алгоритм вскоре был реализован в боевых программах и обеспечивал наведение первой из стартовавших противоракет на последний блок сложной цели, а последней противоракеты – на первый блок, с одновременным подрывом зарядов противоракет. Этот новый, «квазиодновременный» способ поражения баллистических целей стал главной и последней доработкой по модернизации А‑35. Одновременно эта работа стала последней для Г. В. Кисунько, которого в 1975 году сменил И. Д. Омельченко.
Первые модернизированные ракеты А‑350Ж начали поступать в войска в 1974 году. И конечно, вызвали самую серьезную обеспокоенность тех, кому их предстояло эксплуатировать.
Как вспоминал Н. Г. Завалий:
Специалисты «Факела» непосредственно участвовали во всех работах по совершенствованию технологического потока на технической базе. В результате время на заправку противоракеты, установку боевой части и ее транспортировку на стартовые позиции было доведено до полутора суток. Тренировки по транспортировке противоракет от технических баз хранения до боевых позиций, как правило, выполнялись ночью, в любую погоду. Дороги имели крутые спуски и подъемы, мосты, пересечения с высоковольтными линиями передач, с железнодорожными путями. Обычно колонна состояла из двух автопоездов с ракетами, машин сопровождения, заправщиков, подъемного крана, пожарных машин, машин с песком и взвода охраны. Колонну сопровождали машины ВАИ.
В обычном же режиме на стартовых позициях в контейнерах находились электровесовые макеты противоракет, которые обладали всеми системами управления, позволяющими боевому расчету дважды в сутки проверять правильность функционирования всей системы стартовой автоматики. Ускорители макетов были заполнены бетоном, при этом пиропатроны вынесены на поверхность корпуса контейнера, а баки жидкого топлива заполнены песком. Такие же макеты вывозились во время парадов на Красную площадь до конца 1980‑х годов, когда в Подмосковье подошло к завершению строительство системы ПРО второго поколения – А‑135.
Первые проектные предложения по А‑135 были внесены в 1974 году Анатолием Георгиевичем Басистовым, ставшим со временем ее генеральным конструктором. Хорошо знакомый Грушину еще по работам над первыми системами ПВО, над С‑200, Басистов оказался чрезвычайно близок ему не только по своим деловым качествам, но и в плане чисто человеческого общения. С ним Грушин мог работать без использования каких‑либо политических маневров.