Когда Наполеон утром 17 апреля прибыл в Донаувёрт, он застал следующую обстановку: 30 тысяч баварцев под командованием маршала Лефевра еще до подхода главных сил австрийцев в 125 тысяч человек отступили с Изара на Абенс, 51 тысяча французов маршала Даву находились в Регенсбурге, куда направлялись 48 тысяч австрийцев из Богемии. 60 тысяч французов и солдат Рейнского союза под командованием маршала Массена стояли под Аугсбургом, 12 тысяч вюртембержцев генерала Вандама под Райном на Лехе, небольшие силы под Ингольштадтом и Нойбургом. Эрцгерцог Карл 16 апреля сумел форсировать Изар под Ландсхутом, двинув одну дивизию на Мюнхен, а армейский корпус на Моосбург. Намереваясь переправиться через Дунай между Кельхаймом и Ингольштадтом, чтобы соединиться с подступающими из Богемии войсками, эрцгерцог 18-го главными своими силами подошел к окрестностям Рора. Такое развитие событий Наполеон, принимая в течение 17 апреля первые решения, предусмотреть не смог. Он сначала приказал двинуться правому крылу своих войск под командованием Массена в направлении на Пфаффенхофен на Ильме, отвел Даву на правом берегу Дуная в район Нойштадта и приказал Вандаму силами находившихся под Ингольштадтом и Нойбургом дивизий подтянуться на р. Абенс, чтобы там вместе с баварцами он составил бы центр армии. Затем, следуя отданному ему утром 20 апреля приказу, к этому центру должен был двинуть еще две дивизии Массена, в то время как остальные его войска должны были идти маршем на Моосбург, чтобы оттуда воздействовать на шедшие через Ландсхут тыловые коммуникации противника.
Даву удалось 19-го провести рискованный фланговый марш между рекой и войсками противника, установив контакт с баварцами, так как эрцгерцог двинул на Регенсбург лишь 3 корпуса – да и то с опозданием, а еще два корпуса оставил на Абенсе против баварцев, еще один продвинул в Майнберг. Так что Наполеону удалось свои рассредоточенные силы объединить таким образом, что он мог перейти в наступление. Когда император 20-го прибыл в район Абенсберга, на основании донесения из своих частей и личной рекогносцировки он смог прийти к мнению, что находившиеся прямо против него между Большим Лаабером и Абенсом силы австрийцев не особенно велики, а противник до некоторой степени рассредоточен. На Даву, а наступление эрцгерцога 19-го задело его скорее по касательной, нежели по-настоящему затронуло, новых атак не предпринималось; некоторые признаки указывали чуть ли не на общее отступление австрийцев. А его вовсе не предполагалось. Двинутые против Даву корпуса держались выжидательно. Атаки противника там не последовало, а вот на Бахль, Бибург и Зигенбург она состоялась, причем с тем результатом, что находившиеся на этой линии два австрийских корпуса были разбиты, а главные их силы были оттеснены в направлении на Роттенбург и Пфеффенхаузен. Там они поступили под руководство командующего находившегося под Майнбергом армейского корпуса фельдмаршал-лейтенанта фон Хиллера, который теперь, имея до 40 тысяч человек левого крыла австрийцев, еще вечером 20-го начал отступление на Ландсхут. Там 21-го он был отброшен Наполеоном за Изер и в ходе дальнейшего отступления к Инну был взят войсками Массена во фланг. Даву тем временем умело разрешил стоявшую перед ним сложную задачу сковывания находившихся против него превосходящих сил австрийцев между Большим Лаабером и Дунаем. Исход последовал 22-го из-за того, что Наполеон двинул все имевшиеся у него под Ландсхутом силы через Экмюль в левый фланг усилившегося за счет части сил с левого берега Дуная эрцгерцога, когда тот двинулся в атаку на Даву. Австрийская армия была оттеснена за ручей Пфаттер. 23-го последовала переправа под Регенсбургом, при этом вновь дело дошло до ожесточенных боев с наседавшими французами.
Таким образом, Наполеон за несколько дней здесь сумел прорвать вражескую армию и полностью оттеснил друг от друга оба ее изолированных крыла, хотя при этом планомерно к прорыву он не стремился. Скорее в ходе всей операции он находился в полнейшем неведении относительно положения противника. Еще 21 апреля он предполагал, что эрцгерцог на полном ходу отступает перед Даву к нижнему Инну. Известия о тяжелых боях Даву было для него неожиданностью, однако он не медлил ни минуты, сделав необходимые выводы из представившегося тем самым благоприятного для него положения. Блестящим результатом под Регенсбургом Наполеон обязан своей необычайной инициативности. То, что он смог добиться этого столь быстро, конечно, имеет свои причины в вооружении тех времен. Сегодня даже сравнительно небольшие силы австрийцев оказали бы куда более длительное сопротивление той атаке, что была на Абенсе 20-го. Эрцгерцог тем самым получил бы время на то, чтобы избежать худшего. А используя современные средства передачи приказов, он, прежде всего, должен был бы своевременно узнать о судьбе, постигшей его левое крыло, ведь и он в эти критические дни постоянно находился в неведении относительно обстановки.