Другой причиной, объяснявшей застой и упадок в португальских владениях в Азии и Восточной Африке в эти годы, было отсутствие справедливости в судах
«Самое большое зло из всех возможных зол – это когда к людям относятся несправедливо, потому что коменданты крепостей в Индии правят людьми, обладая властью, данной им королем, и при этом берут на себя еще большие полномочия. Они совершают много злоупотреблений, о чем прекрасно знает король. Это и грабежи, и убийства, и неприкрытое насилие в отношении замужних женщин, вдов, девственниц-сирот и открытое сожительство с ними. Жертвами всех этих злодеяний, которые они совершают без страха Божьего и не боясь короля, становятся христиане, мусульмане, индусы, местные жители и иностранцы. И их манере вести себя следуют королевские и мировые судьи, судебные приставы и чиновники казначейства. Ничего бы этого не было, если бы только король приказал прилюдно казнить на набережной Гоа губернатора Индии и при этом в королевском указе было бы сказано, что он был обезглавлен потому, что не выполнял свои обязанности так, как следовало бы».
Принимая во внимание некоторую горячность такого заявления Курейи и признавая, что существовали, хотя и не столь многочисленные, справедливые и неподкупные судьи, факт остается фактом, что вопрос «отсутствия справедливости» занимал выдающееся место в официальной переписке между властями в Лиссабоне и Гоа, а также муниципального совета Гоа.
Это глубоко укоренившееся злоупотребление было осуждено на Первом церковном соборе в Гоа в 1567 г. и во время заседаний на последующих соборах. Даже если судьи и чиновники были честны, сложное португальское законодательство, принятое в самой стране и по всей империи, предоставляло большие возможности для затягивания рассмотрения дела – апелляций, встречных исков и вызова свидетелей и тому подобного, чем широко пользовались адвокаты (включая ставших христианами индийских браминов, которые получили разрешение на судебную практику). Хронист-иезуит Франсишку ди Соза (Соуза) писал в 1698 г. в Гоа: «Португальцы, к большому огорчению, не смогут добиться благоприятного к ним отношения со стороны жителей Востока, пока не будет решен вопрос с отправлением правосудия, пока суды низшей инстанции не научатся быстро рассматривать дела, как это принято в государствах Северной Европы, где успешнее складываются отношения с сельским населением». В то время как правосудие в это время у англичан, голландцев и французов во многих отношениях оставляло желать лучшего, будь то в метрополии или в заморских владениях, весьма знаменательно, что падре де Соза считал европейские суды и судей примером для португальцев.
Оказавшись в XVII–XVIII вв. в тяжелейшем положении, которое усугублялось собственными ошибочными действиями, в условиях кризисной демографической и экономической ситуации португальцы вполне могли задать себе вопрос, как они вообще смогли выжить в Азии и Восточной Африке. «Государство Индия» – обречено, и его падение неизбежно. Таких пророчеств в то время было множество. Это государство уподобляли «лежавшему на смертном одре человеку со свечой в руке». Хотя эта свеча горела еще очень долго, пока ее сознательно не погасили в результате неспровоцированного нападения Индии на Гоа, Даман и Диу в 1961 г. Португальцы на протяжении столетий проявляли удивительную способность выживать в условиях негодного управления сверху и отсутствия дисциплины внизу. И в эти времена им помогали какие-то другие факторы.