Хивинский хан Кутлуг-Мурад и его преемник Сейд-Мухаммед-хан собрали войско и первый удар нанесли восставшим туркменам. В феврале 1856 г. под Ходжейли ханские войска разгромили объединенные силы каракалпаков, казахов, узбеков, туркмен. Начался раскол среди предводителей восстания, Зарлык-торе был выдан хивинским властям и казнен в Хиве.
Часть каракалпаков сразу же после подавления восстания перекочевала к Сырдарьинской линии укреплений и обратилась к российским властям с просьбой о принятии их в российское подданство[187]. В это время началась Крымская война и просьба каракалпаков не была рассмотрена.
В 1858–1859 гг. произошло восстание туркмен-йомудов, но оно также было подавлено хивинским ханом Сейд-Мухаммедом[188]. Это усилило стремление народов Хивинского ханства стать подданными России. В 1857 г. хивинские каракалпаки ходатайствовали через Оренбургскую пограничную комиссию о переходе на российские земли[189].
В конце 1857 г. на Мангышлак прибыли депутация туркмен с письмом «…на имя подполковника Тяукина от туркменского Атамурад-хана и влиятельнейших людей йомутского, икдирского и исенов колен письма, где они изъявляли желание жить на будущее время в мире с киргизами (казахами – Н. Б.) и пользоваться покровительством русского императора»[190].
Осенью 1859 г. кунградские узбеки, каракалпаки, казахи восстали во главе с Мухаммед-Феном и Кулман-бием. Был убит управляющий Кунградским владением Кутлу-Мурад. Мухаммед-Фена от имени повстанцев послал письмо в Оренбург в марте 1859 г. с просьбой «занять Кунград русским отрядом и установить русские порядки»[191]. Одновременно отправили депутацию от туркмен к Оренбургскому и Самарскому генерал-губернатору с письмами, «подтверждая выраженную в 1858 году готовность служить Всероссийскому государю императору, особенно настаивая на том, чтобы вообще русское правительство приняло участие в судьбе разъединенных многих туркменов и устроило их»[192].
Послы Мухаммед-Фены, получив положительный ответ, возвратились обратно.
Часть туркменских феодалов находилась под влиянием англичан[193]. Они вооружались английским оружием и были против прихода русских в Кунград.
Туркменские феодалы нападали на казахов, которые не поддерживали Кунград и построили крепость на р. Таллыке.
В соседней крепости Мулла-Прим обосновались каракалпаки, где защищались от вооруженных отрядов туркмен.
14 июня 1859 г. к Кунграду направился А. И. Бутаков на пароходе «Перовск» с военным отрядом. 21 июня хивинский хан с 10-тысячным войском встретил русские суда около Кубетау, но без сражения отступил к Кунграду. А. К. Бутаков пытался вести переговоры с правителями Кунграда и туркменами о переходе в подданство России[194]. Переговоры оказались безрезультатными. Туркменские феодалы трижды пытались напасть на отряд А. И. Бутакова. Не удалось освободить из туркменского плена казахов и каракалпаков. 1 июля 1859 г. флотилия оставила Кунград[195].
В 1862–1863 гг. каракалпаки продолжили переговоры с российским управляющим казахами Сырдарьинской линии о переходе в подданство России.
Во время наступления российских войск на Хивинское ханство, каракалпаки и казахи не оказывали сопротивления. При заключении договора между Россией и Хивой правый берег Амударьи, населенный каракалпаками вошел в состав России[196].
В 1864 г. начальник Оренбургского отряда Н. А. Веревкин занял город Туркестан; начальник Сибирского отряда М. Г. Черняев взял кокандскую крепость Аулие-Ата. Силами этих отрядов был занят Чимкент, а 15 июня 1865 г. отряд М. Г. Черняева штурмом взял Ташкент.
В январе 1866 г. российские войска форсировали Сырдарью и подошли к Бухарскому ханству. Первыми пали бухарские горда Ура-Тюбе и Джизак, в 1867 г. – Янги-Курган. Было организовано на завоеванных землях Туркестанское генерал-губернаторство с центром в Ташкенте. Первым генерал-губернатором стал К. П. Кауфман. 2 мая 1868 г. он занял Самарканд, а 18 мая – Катта-Курган. После поражения на Зерабулакских высотах бухарской армии, был заключен мирный российско-бухарский договор, по которому Самарканд, Ура-Тюбе, Ходжент, Джизак вошли в состав России[197].
К походу на Хиву тщательно подготавливались. В нем участвовали войска трех округов: Кавказского во главе с генералом А. А. Ломакиным, Оренбургского под командованием генерал-лейтенанта Н. А. Веревкина и Туркестанского под начальством генерал-губернатора К. П. Кауфмана. Четырьмя колоннами войска двинулись к Хиве. Джизакская колонна прошла от Ташкента до Хивы 900 верст. Казалинская колонна преодолела 1000 верст, а Оренбургская – 1400 верст. Кавказский отряд шел с побережья Каспия – 800 верст[198].
По данным А. И. Макшеева, в наступлении на Хиву участвовал туркестанский отряд: 5200 человек, 22 орудия, 8 ракетных станков; оренбургский отряд – 3500 чел., 12 орудий, 6 ракетных станков; кавказский отряд – 4300 чел., 22 орудия, 6 ракетных станков; всего 13100 чел., 56 орудий, 20 ракетных станков[199].