В 1785 году в Прибалтике начали действовать Жалованные грамоты дворянству и городам, еще сильнее подорвавшие исключительное положение немцев. Вторая из них вводила иерархию горожан – купцов, лавочников, ремесленников, – основанную на имущественных критериях, а не социальном или этническом происхождении. В 1782 году были упразднены таможенные барьеры между Лифляндией и Эстляндией, с одной стороны, и остальной империей – с другой, что нарушило монополию купцов-немцев и привело к активизации торговли, которая велась через Ригу. Жалованная грамота дворянству создавала дополнительные возможности для занятия должностей и приобретения земли дворянами ненемецкого происхождения – русскими, польскими и другими. И все же немецкая знать по-прежнему занимала господствующие позиции в органах управления; русский язык использовался только в губернских учреждениях, на более низком уровне применялись немецкий язык и немецкое право. По словам Джона Ледонна, в Выборге реформа, как ни парадоксально, привела к еще большему сосредоточению власти в руках землевладельцев, занимавших выборные должности, и снизила роль заседателей из числа крестьян. Тем не менее, шведский язык употреблялся в местных судах еще в 1790-е годы. Прибалтийские немцы потеряли контроль над институтами, но сохранили господствующее положение на местах и не утратили сплоченности. Постепенно они стали частью общеимперского дворянства и чиновничества, образование которых и было одной из целей Екатерины.
Если брать Прибалтику, то от екатерининских реформ больше всего пострадали городские низы и крестьянство. Ливонских крестьян и горожан в 1783 году обложили подушной податью, заменившей прежнюю поземельную; ее уплата еще больше закрепила зависимое положение крепостных. Крестьяне поднимали восстания, но не смогли ничего добиться. При Павле I для крестьян Ливонии и Финляндии была введена рекрутская повинность, как и для некоторых народов Среднего Поволжья. Таким образом, они вошли в число тех немногих неславянских народностей, которых коснулись эти две повинности, отличавшие крестьян восточнославянского происхождения.
В ходе разделов Польши к Российской империи отошли новые территории, на которых проживали латыши и прибалтийские немцы – Латгалия (Инфлянтия) и Курляндия. Латгалия, столицей которой был крупный город Даугавпилс (Двинск) оказалась в составе России в 1772 году, после первого раздела, став частью Витебской губернии. То была аграрная юго-восточная часть Ливонии, присоединенная к Речи Посполитой в XVII веке; католическая знать различного происхождения (поляки, литовцы, украинцы) и немцы-лютеране держали здесь в крепостной зависимости латгальских (говоривших на латышском языке), польских и литовских крестьян. К услугам правящего сословия были польские шляхетские права, парламентские институты и польская культура; русские власти сохранили все это за ним. Население также было разнообразным по составу (оценочные данные на 1784 год): 62 % католиков, 31 % униатов, 4 % лютеран, 2 % иудеев, менее чем по 1 % других реформатов и старообрядцев.
Курляндское герцогство – основная его часть была расположена на полуострове, замыкающем с запада Рижский залив, – создал в 1561 году великий магистр Ливонского ордена Готхард Кетлер во время секуляризации орденских владений. Герцогство вошло в состав Речи Посполитой на правах автономии. Находясь под властью семейства Кетлеров, нередко вступавшего в конфликт с немецкой знатью, оно процветало благодаря судостроению, торговле и промышленному производству. Более того, в XVII веке Курляндия ненадолго обзавелась колониями в Африке и Вест-Индии. Крестьяне, преимущественно латыши, были крепостными. В XVIII веке герцогство, как и вся Речь Посполитая, постепенно втягивалось в зависимость от России. Петр I выдал свою племянницу Анну Иоанновну за курляндского герцога (1710); в 1711 году она овдовела и правила Курляндией, пока не стала русской императрицей (годы царствования 1730–1740). Как в Митаве, так и в Петербурге она опиралась на курляндских немцев. Взойдя на русский престол, Анна Иоанновна всячески покровительствовала Курляндии и после того, как в 1737 году пресекся род Кетлеров, сделала герцогом своего фаворита Эрнста Бирона. Герцогский двор в Митаве стал своего рода форпостом петербургской культуры; столицу украсили барочные здания, построенные Растрелли. После третьего раздела Речи Посполитой (1795) последний герцог подписал отречение, и Курляндия вошла в состав России. На ее территории сразу же начали осуществляться российские административные реформы, было введено деление на уезды, но местные должности стали занимать представители немецкой знати. Таким образом, на короткий период было обеспечено сохранение статус-кво – до тех пор, пока Павел I не стал отменять екатерининские реформы (с 1796 года). В 1801 году курляндских крестьян официально освободили от рекрутской повинности – еще одно свидетельство того, что с крестьянами различных национальностей на окраинах империи обращались по-разному.