Во всей стране начались новые административные и юридические порядки: судебная часть отнималась у губернаторов, земские приказы были изъяты из ведомства администрации. В провинциях были введены воеводы, которые надзирали за отправлением правосудия. Сбор доходов возлагался на земских комиссаров. Они наблюдали за приемом казенного хлеба, казенных вещей, за отпуском провианта.
Финансовая часть находилась в руках земских камеридов или казначеев. Они вместе с губернатором наблюдали за сбором доходов в губерниях и провинциях.
28 февраля 1720 года был составлен генеральный регламент о порядке занятий и движении дел во всех коллегиях. Все коллегии находились под ведением сената, без его одобрения не могли печатать своих приговоров и указов. 29 мая 1719 года был издан сенатский указ об устройстве губерний. Все губернии разделялись на провинции, а провинции – на уезды. Для отправления корреспонденций коллегий и донесений из губерний были устроены почты от Санкт-Петербурга до всех значительных городов. Купеческие письма на этой почте не принимались.
Петр в какой-то мере осуществил свою идею преобразовать русские города по европейскому образцу. 16 января 1721 года был издан регламент главного магистрата. Все русские города приводились в зависимость от центрального места, называемого главным магистратом, где председательствовал обер-президент с членами. Главный магистрат утверждал во всех русских городах магистраты, снабжал их уставами и управлял ими. Города делились на разряды, в зависимости от количества в них дворов. Город состоял из торговых людей и ремесленников. Для них и существовал магистрат. Они разделялись на две гильдии: к первой принадлежали банкиры, знатные купцы, доктора, аптекари, шкиперы купеческих кораблей, мастера золотых и серебряных дел, живописцы, иконники и другие, производящие искусство в большом размере. Ко второй гильдии принадлежали мелкие торгаши, владельцы харчевен, менее значительные ремесленники. Люди, проживавшие наймами, не принадлежали к гильдиям и не зависели от магистрата. Из числа зажиточных, умных граждан избирали магистрат, а он президента. В менее важных городах избирали бургомистра. В каждом большом и среднем городе строились ратуши в каменном исполнении.
Вскоре был издан также регламент духовной коллегии о сочетании мирской жизни с церковной. По духовному регламенту запрещалось кому бы то ни было, кроме царской семьи строить церкви и держать крестовых попов. В духовной коллегии было не менее 12 человек, в том числе трое должны были носить архиерейский сан, а остальные были архимандритами, игуменами, протопопами.
Медицинская часть в России до этого была оставлена без внимания. В августе 1721 года была учреждена медицинская контора, управляющая всей медицинской частью. Ей были подчинены все врачи и аптекари. До того в России не было ни одного медицинского учебного заведения, все врачи и аптекари были иностранцами.
Перестраивалось государственное управление судами. Петр принял за образец для составления нового русского уложения готовое шведское и указом от 1720 года приказал учредить судебную комиссию, в которой были в основном иностранцы.