Примерно в 1910 году русские и американские торговцы из Сарая и Термеза внедрили американский хлопок в бекстве Курган-Тюбе, где он начал медленно, но устойчиво вытеснять местные сорта. Во время Первой мировой войны американский хлопок чрезвычайно распространился в Центральной Бухаре. Стремясь получить больше центральноазиатского хлопка для замещения утраченного импорта, Россия в 1915 году настояла, чтобы эмир купил 17 вагонов американских семян и распределил их между своими крестьянами по фиксированной цене. Хлопок, на 90 % американский, был впервые посеян в большом масштабе в бекствах Байсун, Денау, Гиссар, Кабадиён, Курган-Тюбе и Куляб. В 1915 году эти провинции, плюс Ширабад, где хлопок как культура был уже хорошо известен, произвели почти 800 000 пудов из общего количество бухарского хлопка в 2 700 000 пудов.
В Хиве культура хлопка развивалась быстрее, чем в Бухаре, отчасти благодаря более широкому выращиванию американского хлопка, особенно с конца 1890-х годов. К 1904 году половина площадей возделывания хивинского хлопка приходилась на американские сорта, а к 1914-му они составили две трети.
Бухара и Хива никогда не имели узкоспециализированной монокультурной экономики, как в Фергане. В первой декаде XX века в Бухаре площадь земель, отведенных под хлопок, составляла менее 5 %. 50 % земель занимала пшеница, выращиваемая для использования в домашнем хозяйстве. Даже в долине Заравшана, составлявшей 80 % от общей площади земель, отведенных под хлопок, он занимал только 25 %, тогда как пшеница – 40 %. Хотя с 1913 по 1916 год в Бухаре площади выращивания хлопка увеличились на 76 %, доля посевов хлопка из общей площади пахотной земли ненамного превышала 5 %. Для сравнения: в Ферганской области, составлявшей почти две трети площадей посевов хлопка в русском Туркестане и Закаспийской области, в 1915 году хлопок занимал от 36 до 38 % общей площади пахотной земли, а в основных производящих хлопок уездах эта цифра доходила до 95 %.
В Хиве, несмотря на то что с начала 1880-х годов до начала 1890-х площадь посева хлопка удвоилась, она составляла всего 10 % пахотной земли. К началу Первой мировой войны площадь посева хлопка удвоилась еще раз до 48 900 десятин, но это занимало всего 16 % от всей пахотной земли. Даже в южной части оазиса, являвшейся главным районом по производству хлопка, площадь его посева составляла всего 18 %. Пшеница занимала 24 % пахотных земель ханства, а люцерна почти столько же, сколько хлопок. Таким образом, Хива специализировалась на выращивании хлопка значительно больше, чем Бухара, но даже не приближалась к специализации Ферганы.
В каждом из центральноазиатских протекторатов России пшеница по-прежнему превосходила хлопок как по площади посева, так и по размеру урожая. Даже самые главные районы по производству хлопка, долина Заравшана и Южная Хива, в отличие от Ферганы, оставались самодостаточными по продовольствию, и большая часть хлопка выращивалась мелкими крестьянами не как основная культура, а как вспомогательный источник дохода.
Развитие промышленности
Современная промышленность в незначительном масштабе пришла в русскую Центральную Азию вместе с железной дорогой. Внезапное и резкое увеличение экспорта хлопка в Россию потребовало создания местной индустрии по производству хлопка-сырца – отделение и прессование волокна, а также получение масла из семян.
В Бухаре до Первой мировой войны развитие этой индустрии ограничивалось исключительно русскими поселениями и железнодорожной зоной и хлопкоочистительные фабрики принадлежали преимущественно русским. Первые две паровые хлопкоочистительные фабрики – обе принадлежали русским – открылись одна в Чарджоу в 1889 году, другая в Новой Бухаре на следующий год. К 1904 году всего в стране было девять хлопкоочистительных фабрик, из них три в Новой Бухаре. Они фактически заменили старые местные ручные приспособления. Через четыре года весь бухарский хлопок очищался и прессовался на месте 17 фабриками, принадлежавшими русским: девять из них располагались в Новой Бухаре, четыре – в Чарджоу и по одной в Кермине, Кизыл-Тепе, Каракуле и Термезе. К 1913 году их стало 26, из которых 19 принадлежали русским, три – русским татарам, три – эмиру Бухары и одна – бухарскому купцу. Также к 1913 году появилось две маслобойные фабрики – в Новой Бухаре и в Чарджоу. В 1916 году на волне военного хлопкового бума в Бухаре было 35 хлопкоочистительных фабрик, из которых четыре принадлежали эмиру, и три маслобойни. Впервые хлопкоочистительная фабрика за пределами русских поселений и железнодорожной зоны появилась в Центральной Бухаре в низовьях реки Вахш, в Джиликуле, чтобы обслуживать этот новый район производства хлопка.