После убийства царем своего сына нарушился с трудом сохранявшийся политический баланс при дворе, поскольку все правившие кланы, группировавшиеся вокруг совершеннолетнего наследника престола, почувствовали себя оторванными от будущего обладателя законной власти. Из-за семейной трагедии у кормила власти неожиданно оказалась семья второстепенного генеалогического достоинства, погрязшая в пороках, даже возвысившаяся во время опричнины. Это были братья и дядья жены Федора Ирины Годуновой, которые впоследствии вершили политические судьбы империи. Годом позже, в октябре 1582 г., у царя от его (седьмого) брака с Марией Нагой родился сын Дмитрий, чье существование как здорового сына Ивана IV, несмотря на незаконнорожденность, делало развитие событий полностью непредсказуемым ввиду очевидной неспособности Федора к управлению.
К этому добавлялась неопределенность, связанная с английскими планами Ивана IV. Иван IV постоянно вел переговоры о браке с племянницей английской королевы Марией Гастингс и о гарантии предоставления убежища для себя. Кроме того, он велел построить порт на Белом море, впоследствии названный Архангельском, здесь почти столетие спустя Петр I принял решение о развитии мореплавания. Настойчивость, с которой Иван IV занимался английскими планами, должна была пробудить опасения в тех аристократах, в чьих руках он практически находился. Осознание ими того, что слабоумный Федор Иванович представляет наименьшую угрозу для их жизни и будущего империи, привело к мысли об устранении непредсказуемого тирана. Из сообщения Джерома Горсея становится ясен сценарий насильственной смерти: Ивана IV отравили с помощью медика Иоганна Айлоффа, и, после того, как царь потерял сознание во время игры в шахматы, его удавили. Обследование могилы показало, что вместе с покойным положили и монашеское платье; так было выполнено давнее желание Ивана IV незадолго до смерти стать другой личностью. Официальная версия его смерти гласит, что Иван IV перед кончиной постригся в монахи и получил имя Иона.
Образ Ивана Грозного при более близком знакомстве выглядит особенно захватывающим. После нескольких лет охотного вживания в роль боговенчанного царя, покорно служащего христианскому народу и православной церкви, под влиянием неизвестного нам импульса, он нарушил все границы условностей: царь предается насилию, разрывающему его душу. Он бежит из Кремля, неожиданно покидает Москву, отдается ненависти, пугающим и одновременно сладостным убийствам, экзальтированному покаянию. Он почти вынужденно нарушает общественные табу. Так он попирает таинство брака — как известно, уже четвертый брак в православии считается проклятым, как «скотский». Из замечания Джерома Горсея, перед которым царь хвалился тем, что «он лишил невинности тысячу девственниц и лишил тысячу детей возможности произвести потомство», можно сделать заключение о возможной бисексуальной активности Ивана IV. Трудно определить, страдал ли Иван IV паранойей, как считают некоторые американские ученые, или бредовыми состояниями с присущей им агрессией, был ли он действительно душевнобольным в патологическом смысле. Правда, такая гипотеза облегчает объяснение некоторых фактов. Одно достоверно установлено: царь постоянно страдал от мучительных болей, прежде всего в спине и суставах. По скелету Ивана Грозного, ставшему практически неподвижным из-за раннего окостенения хрящей и многих сухожилий, медики определили наличие полиартрита, спондилоза и артроза. Царь пытался заглушить боли алкоголем, кроме того, его беспомощные медики прописывали ему некоторые травы и сомнительные лекарства, среди них ртутные мази от болей в суставах, дающие разного рода негативные последствия. Резкие смены образа жизни, а также психические нагрузки с годами все больше разрушали первоначально крепкое физическое здоровье Ивана IV и сделали его страдающим от болей, преждевременно состарившимся алкоголиком. От очевидца событий Джерома Горсея мы знаем, что в последний год жизни Ивана IV носили сидящим на стуле, поскольку он практически не мог передвигаться.