Военные действия между Россией и Англией происходили только на море. Английский флот действовал против русских кораблей в Атлантическом океане, на Адриатическом, Балтийском и Баренцевом морях, на русских коммуникациях, захватывая русские суда. Это наносило огромный материальный ущерб экономическим связям России. Дворянство и купечество открыто выражали свое недовольство Тильзитским миром.
Действия в Атлантическом океане, судьба эскадры Д.Н. Сенявина
Первыми жертвами войны Англии с Россией стали фрегат «Спешный» (капитан-лейтенант Н.Г. Ховрин) и транспорт «Вильгельмина» (капитан-лейтенант К.М. Пильгард). Фрегат должен был доставить на эскадру Д.Н. Сенявина в Средиземном море 601 167 испанских пиастров и 140 197 голландских червонцев. Деньги были погружены на фрегат в бочонках. Транспорт вез обмундирование. На фрегате находился князь А.Н. Голицын с семьей, который направлялся в Англию. Фрегат считался лучшим ходоком в Балтийском флоте, а транспорт был тихоходным.
21 июля 1807 г. суда вышли из Кронштадта. От Дагерорта русские суда шли под наблюдением английских крейсеров (держась на большой дистанции, они следовали за отрядом). 3 августа суда зашли в Копенгаген и в тот же день продолжили плавание. Князь Голицын заявил командиру фрегата об «отчаянной болезни княгини и ее сыновей» и потребовал, чтобы фрегат оставил транспорт и поспешил в порт. 5 августа фрегат ушел вперед и 11 го прибыл в Портсмут. Транспорт «Вильгельмина», задержанный противными ветрами, только 8 октября пришел в Ярмут.
Н.Г. Ховрин медлил с выходом, т. к. не знал о месте нахождения эскадры Д.Н. Сенявина. 20 ноября «Спешный», стоявший на Портсмутском рейде среди английских кораблей, был окружен вооруженными барказами и взят в плен, т. к. командир фрегата не знал о начале войны.
Пройдя с эскадрой (девять кораблей и фрегат) 5 октября 1807 г. Гибралтарский пролив, не заходя в порт Гибралтар и намереваясь из-за натянутых отношений с Англией обогнуть Британские острова с севера, чтобы в случае невозможности пройти в Балтийское море и зимовать в одном из норвежских портов, Д.Н. Сенявин встретил в Атлантическом океане сильные и противные ветры, не прекращавшиеся двадцать суток. «Мы, – пишет находившийся на борту «Рафаила» лейтенант П.И Панафидин, – качались по ужасным волнам, почти не продвигаясь вперед». Многие суда получили опасные повреждения, команды изнурились до крайности почти беспрерывными, тяжелыми работами. Утром 26 октября направление ветра изменилось, и эскадра быстро пошла заданным курсом. Но через несколько часов ветер снова изменил направление. Он все крепчал и перешел в сильнейший шторм. Корабли получили различные повреждения: на «Рафаиле», «Ярославе» и «Селафаиле» открылась сильная течь, на «Ретвизане» сломался руль. Командиры кораблей сообщили адмиралу, что дальше следовать не могут. Чтобы не подвергать корабли опасности и для исправления полученных повреждений, Д.Н. Сенявин 28 октября вынужден был зайти в Лиссабон.
Здесь он внимательно осмотрел все корабли и убедился в том, что они требуют серьезного ремонта. О продолжении похода нечего было и думать. И Сенявин известил Александра I о том, что он вынужден остаться в нейтральной Португалии до марта 1808 г.
Фрегат «Венус» вскоре ушел из Лиссабона в Средиземное море на поиск отставших кораблей капитан-командора И.А. Баратынского, а шлюп «Шпицберген», отставший от эскадры, штормом загнало в испанский порт Виго, где он и остался.
Португальское правительство оказало Д.Н. Сенявину радушный прием, направило в его распоряжение корабельного мастера и обещало «сделать другие пособия». Однако Наполеон нарушил нейтралитет Португалии. Стремясь овладеть всем Пиренейским полуостровом, французский император ввел в октябре 1807 г. свои войска во все важнейшие крепости Испании, а 18 ноября/1 декабря захватил Лиссабон. Португалия была оккупирована французским корпусом под командованием генерала Ж. Жюно. В то время как французы приближались к Лиссабону по суше, с моря к нему подошли англичане. Их намерения стали ясны, когда 15/27 ноября они не пропустили в устье Тахо шлюп «Шпицберген», шедший на соединение с эскадрой Д.Н. Сенявина.
Спустя две недели после появления русских кораблей у Лиссабона правительство страны, принц-регент и королева бежали в Бразилию, которая была в ту пору португальской колонией. 7/ 29 октября португальский флот (восемь линейных кораблей и два фрегата) покинул Лиссабон и ушел в Рио-де-Жанеро со всей королевской семьей. Португальцы опасались, что русские, ставшие формально союзниками Франции, могут воспрепятствовать выходу их флотилии, но Д.Н. Сенявин соблюдал нейтралитет.