Французы всячески старались добиться от Д.Н. Сенявина сотрудничества в борьбе с британским флотом, который блокировал Лиссабонский порт. Когда Александр I выполнил требования Тильзитского договора и объявил в октябре 1807 г. войну Англии, Наполеон поторопился известить об этом Сенявина. Через своего морского министра он призвал русского адмирала использовать в борьбе с английским флотом «все преимущества, которые могут представиться».
Не очень рассчитывая на готовность Д.Н. Сенявина служить французским интересам, Наполеон обратился к царю с просьбой подчинить русскому послу в Париже графу П.А. Толстому сенявинскую эскадру, чтобы ее «можно было пустить в ход, не ожидая прямых указаний из Петербурга». Заинтересованный тогда в сохранении Тильзитского мира, Александр I немедленно удовлетворил это требование.
А 1 марта 1808 г. царь уступил новым домогательствам Наполеона и издал указ о предоставлении русских морских сил в Средиземном море и в Атлантике в полное распоряжение Франции.
В июне 1808 г. Ж. Жюно предупредил Д.Н. Сенявина о том, что англичане намереваются высадить десант для соединения с непокорными Франции португальцами и испанцами и сжечь русскую эскадру. Поэтому французский генерал предложил русскому адмиралу высадить на берег находившихся на его кораблях солдат и присоединить их к французскому корпусу.
Целых два месяца французский генерал добивался, чтобы Д.Н. Сенявин направил русские войска для борьбы с врагами Наполеона на Пиренейском полуострове, чтобы он атаковал английский флот у Лиссабона. Но все усилия были тщетны. Несмотря на то что царь полностью подчинил сенявинскую эскадру и войска Наполеону, она не приняла никакого участия в военных действиях в Португалии.
Д.Н. Сенявин счел за лучшее соблюдать строгий нейтралитет: он не помешал отъезду королевской флотилии и не оказывал французам никакого содействия, чтобы не дать португальцам повода к неудовольствию на русских. Когда Ж. Жюно просил свезти русский десант для занятия некоторых береговых укреплений, Д.Н. Сенявин отвечал, что в случае нападения англичан на французов он будет деятельно помогать последним, как своим союзникам, но враждебно действовать против португальцев или испанцев не может, потому что Россия не находится в войне с ними, и он не властен объявить себя их неприятелем.
Д.Н. Сенявин был глубоко убежден в том, что помощь Ж. Жюно принесла бы России только вред, и совершенно не намеревался проливать кровь русских людей во имя интересов Наполеона.
В июле в Португалию прибыл британский экспедиционный корпус под командованием генерал-лейтенанта А. Веллингтона. 9 августа 1808 г. Ж. Жюно потерпел поражение в бою у местечка Вемиэйро и вынужден был уйти из Португалии. Англичане заняли Лиссабон.
В проекте конвенции, заключенной при сдаче города, по настоянию Д.Н. Сенявина было сказано, что, после занятия англичанами Лиссабона, город остается нейтральным для русских, поскольку Португалия и Россия не воевали между собой. Но командующий блокирующей английской эскадры вице– адмирал Чарлз Коттон не принял этой статьи.
Что оставалось делать Сенявину? Сами англичане признали состояние его эскадры «чрезвычайно бедственным»; и если бы русская эскадра и вышла из устья реки Тахо, где она стояла, то в печальном исходе сражения с сильнейшим английским флотом (13 кораблей, 11 фрегатов и 5 мелких судов) сомневаться было невозможно.
Положение сенявинской эскадры стало еще более сложным, чем раньше. Так как Англия находилась в состоянии войны с Россией, командующий английской эскадрой предъявил Д.Н. Сенявину требование сдаться в плен со всеми кораблями и войсками. В первоначальной инструкции Адмиралтейства Ч. Коттону, представленной впоследствии в парламент, указывалось, что «завладение Российскою эскадрою сделалось предметом величайшей важности» и что для содействия Ч. Коттону с суши, в «приобретении того предмета», в Лиссабон специально высылаются корпуса генералов Мура и Спенсера.
В таком положении Сенявину оставалось или принять неравный бой с сильнейшим неприятелем, или исполнить полученное им еще 10 февраля приказание Александра I, в котором выражалась надежда, что в случае нападения англичан на эскадру неприятель будет отражен; но «