Во второй половине 1785 года граф Брюс и архиепископ Московский Платон получили два указа, которые требовали духовной и светской ревизии всех частных школ и училищ в Москве, а затем и ревизии книг, вышедших из новиковской типографии. В указе говорилось, что в школах допускается «суеверие, развращение и обман», а среди книг печатаются «многие странные книги»; затем требовалось, чтобы впредь не появлялись книги, в которых заключается «колобродство, нелепые умствования и раскол». Сверх того, архиепископу предписывалось испытать Новикова в Законе Божием. Это было первое серьезное предостережение, сделанное императрицей. Московский губернский прокурор А. А. Тейльс нашел только две вредные книги, напечатанные в университетской типографии Новикова, другие же вредные книги печатались в компанейской типографии, или в типографии Лопухина. Так как все эти типографии находились в распоряжении Новикова, то очень возможно, что компания избегала печатать в университетской типографии наиболее опасные книги. Впрочем, на этот раз в руки следователей еще не попали книги, напечатанные в тайной типографии без надлежащих разрешений; эти книги как раз имели наиболее важное значение. В общем, Тейльс опечатал, считая нужным подвергнуть рассмотрению, 461 название книг, продававшихся в книжной лавке Новикова. Книги были рассмотрены цензорами, назначенными архиепископом Платоном. В Управе благочиния Новикову пришлось давать показания о печатании книг в его типографиях. Платон нашел среди книг, предложенных ему для рассмотрения, частью книги зловредные, частью книги мистические, которых архиепископ, по его сознанию, не понимает, и частью книги, полезные для общества.
Весь этот розыск кончился для Новикова на этот раз довольно благополучно. Архиепископ Платон признал Новикова хорошим христианином, найдя удовлетворительными все его ответы касательно веры.
Книги, признанные Платоном зловредными, не особенно испугали императрицу, потому что среди них были сочинения энциклопедистов и т. п. Указ 27 марта 1786 года запрещал продажу только шести книг, как раз книг масонского направления. Тот же указ вообще заключал в себе угрозу в адрес Новикова и его типографий, запрещая печатать книги, исполненные «странных мудрований».
Но одновременно царское правительство стало преследовать и благотворительную деятельность Новиковского кружка. Указом от 23 января 1786 года повелевалось все частные школы и больницы в Москве, кроме имеющих особые привилегии и состоящих в особом правлении светского или духовного начальства, подчинить ведомству Приказа Общественного Призрения и вообще иметь наблюдение за всеми учреждениями Новиковского кружка[281]
.В следующем году преследования приняли уже более серьезное направление. По-видимому, раздача Новиковым хлеба простому народу в голодный 1787 год послужила толчком к интенсивным мерам против кружка. В этом году последовало запрещение печатать в светских типографиях книги[282]
, относящиеся к церковному или Священному Писанию, запрещена продажа этих книг в частных лавках, что грозило совершенным прекращением издательской деятельности Новиковского кружка; наконец, последовало запрещение отдавать Новикову университетскую типографию[283]. В 1791 году в Москве появляется известный граф Безбородко, имевший целью негласно произвести следствие о масонах. Он имел очень широкие полномочия, но удалился из Москвы для доклада императрице, не начав формального следствия, видимо не считая его нужным («Записки» Лопухина в «Русском архиве»[284]).