Собственность ордена в городе Иерусалиме и его окрестностях в XII в. находилась в управлении Главного командора, хотя и существовали отдельные чиновники, ответственные за сбор ренты. К 1186 г. относится первое упоминание о командоре Вифании
, об обязанностях которого ничего не известно. Значительными земельными владениями, расположенными к западу от Иерусалима вдоль дороги, ведшей к побережью, управляли командор Эммауса и кастелян Бельмонта, о которых известно с 1170 г. Поместья на плодородной низменной равнине между Кесарией и Яффой могли в 1166–1187 гг. находиться под контролем командора Спины. Потеря Иерусалима и большей части Палестины привела к тому, что во владении госпитальеров остались дишь приморские земли, что могло вызвать необходимость провести их реорганизацию. В первой половине XIII в. всей собственностью ордена в южной части Палестины управлял, возможно, командор Яффы. Землями в сеньории Кесария управляли из ее административного центра.Земельные владения Госпиталя в Галилее находились, вероятно, в управлении командора Тиверии
, о котором упоминается в 1165 г., и в важном ранге бейлифа он оставался в своей должности до 1182 г. Некоторые из поместий коменды вошли в состав владений кастеляна Бельвуара. Кастеляны назначались с 1173 до 1189 г., когда замок захватил Саладин. Затем Бельвуар был отбит и окончательно перешел в руки мусульман в 1247 г. Однако в XIII в. ни коменды, ни кастелянии уже не существовало. Их бывшими землями могли управлять непосредственно из Акры, но приобретение горы Фавор в 1255 г. привело к созданию новой кастелянии, которая контролировала большую часть земель в Восточной Галилее и в диоцезе Назарета. Вероятно, в сферу ответственности командора Акры, о котором известно с 1155 г., входили сам город и его сеньория, западная Галилея и сеньория Кайфас. В XIV в. это была крупная административная структура; здесь имелся свой госпиталь, штат священников и казначейство. После 1191 г. ее значение выросло в связи с переходом Центрального конвента в Акру. Северные земли коменды отошли, вероятно, к вновь образованной в 1212 г. коменде под управлением командора Мануэта. Впоследствии о ней упомянули лишь единожды: Генеральный капитул 1301 г. постановил, что замком Колосси на Кипре должно управлять по тем же правилам, что и Мануэтом. Колосси был одним из центров коменды Кипра, и это дает возможность предположить, что Мануэт занимал важное положение в своей коменде. Земельная собственность госпитальеров в сеньориях Тир, Торон, Сидон и Бейрут контролировались, видимо, командором Тира.Поместьями в графстве Тир к северу от Па-ду-Шьен управлял бейлиф, известный вначале как приор
или командор Мон-Пелерена. Между 1182 и 1192 гг. командор Мон-Пелерена получил титул командор Триполи. В 1283 г. коменда имела собственное казначейство. Земли большого палатината на северо-восточной границе графства в окрестностях замка Крак-де-Шевалье могли, вероятно, объединить в коменду только в конце XII в. Госпитальеры даже предложили королю Богемии (Чехии) остановиться в замке во время его паломничества в Святую землю. В 1170 г. появилась должность кастеляна Крак-де-Шевалье; его преемники взяли под свой контроль земли ордена в северной части графства. Кастеляния имела свое казначейство и канцелярию.Земли на юге княжества Антиохия находились под управлением командора Лаодикеи и Гибелы (Джаблы)
, о чем имеется свидетельство 1183 г. Приобретение замка и сеньории Маргат в 1186 г. имело следствием реорганизацию администрации на этой территории. Земли, принадлежавшие прежде синьории, перешли под контроль кастеляна Маргата, который был назначен сразу же после приобретения замка. В кастелянии был свой штат священников, казначейство и канцелярия. Сеньория Мараклея, располагавшаяся на побережье к югу от Маргата, в течение какого-то времени в XIII в. находилась, вероятно, под сюзеренитетом госпитальеров. Возможно, по этой причине в 1257 г. упоминается командор Мараклеи. Но сомнительно, чтобы существовала подобная коменда. Земли на севере княжества и, возможно, на Киликийской равнине составляли важное отдельное владение под управлением командора Антиохии, у которого, несомненно, был свой казначей.Земли ордена в Латинской Армении контролировались вначале кастеляном Селефкие (Селевкии)
. Орден владел замком с 1210 по 1226 г. В 1210 г. кастелян имел помощника командора, которому могли быть делегированы полномочия по организации новых земельных марок госпитальеров на западе королевства. После потери замка орден учредил в 1248 г. должность командор Армении. Он имел помощника казначея; возможно, казначейство Антиохии было переведено в Киликийскую Армению после захвата города мусульманами.