Параллельно с «Комсеверпути» постановлением СНК СССР № 1873 от 17 декабря 1932 г. было создано Главное управление Северного морского пути, задача которого определялась так: «…проложить окончательно Северный морской путь от Белого моря до Берингова пролива, оборудовать этот путь, держать его в исправном состоянии и обеспечить безопасность плавания по этому пути
». Таким образом, появился еще один организационный центр развития Арктики. Учитывая эту тенденцию, руководитель «Комсеверпути» Б. В. Лавров писал: «Северный Морской Путь не может превратиться в самоцель. Сырьевые богатства Севера должны дать достаточную нагрузку для его судов. Индустриализация Севера немыслима без создания местных кадров, приспособленных к климатическим условиям, и значительного дополнительного заселения. Это в свою очередь тесно связано с задачей снабжения северных индустриальных центров как путем завоза пром.– и прод. товаров, так путем создания местных снабженческих баз <…>. Естественно, что при таком положении дела становится необходимым создание одного волевого центра, управляющего всей этой работой. Все это вместе взятое говорит о необходимости создания одного северного центра с директивными функциями, который бы представлял объединенные интересы Севера перед партийными и советскими органами <…>. Поскольку основной ведущей проблемой Севера на сегодня является Северный Морской Путь, таким директивным центром должен явиться ГУСМП при СНК СССР». Б. В. Лавров, во избежание дублирования задач, предлагал впрямую слить «Комсеверпуть» с Главсевморпутем и возложить на управление:«1) задачу по изучению и эксплоатации сквозного Северного Морского пути от Белого моря до Берингова пролива и 2) задачу по развитию производительных сил районов Крайнего Севера, в целях создания грузов для этого пути. ГУСМП после объединения с Комсеверпутем, помимо работы по освоению и эксплоатации сквозного Северного Морского Пути, будет иметь в своем ведении 3 комбината:
а) Енисейский, с центром на Игарке или в Дудинке,
б) Уральский, с центром в Обдорке или Тобольске, и
в) Якутский, с центром в Якутске.
Эти комбинаты являются органическим добавлением Северного Морского Пути, так как в основном они будут исполнять те оперативные задания, которые падают на ГУСМП (строительство портов, станций, создание угольных баз, организация каботажного плавания и т. д.). Кроме того, своей работой будут стимулировать рост грузооборота по сквозному Северному Морскому Пути
» (Лавров, 1933: 13–16).Постановлением СТО от 11 марта 1933 г. № 250 «в целях развития естественных производительных сил севера правильной их эксплоатации
» Всесоюзное объединение Народного комиссариата внешней торговли «Комсеверпуть» со всем его активом и пассивом было передано Главному управлению Северного морского пути при СНК Союза ССР. Главсевморпути поручалось ликвидировать «Комсеверпуть» как объединение и на базе его создать в системе ГУСМП следующие хозрасчетные организации: