Уже в конце 1820‑х гг. выпускниками академий готовились иногда сочинения, вызывавшие удивления у признанных научных авторитетов тех лет. Так, например, митрополит Киевский Евгений (Болхови тинов), рассматривая магистерское сочинение выпускника КДА 1827 г. Ф. С. Шимкевича «О просвещении древних евреев, или об их успехах в изящных искусствах и науках», был поражен необыкновенной начитанностью автора, его историческими и словесными познаниями, умению выявлять и истинные научные причины тех или иных исторических явлений[988]
. Было опубликовано и признано полезным и с научно-богословской, и с церковно-практической точек зрения выпускное сочинение магистра той же академии 1831 г. выпуска Ореста Новицкого «О духоборцах»[989]. Магистерская диссертация иеромонаха Макария (Булгакова) 1841 г. выпуска КДА составила событие в русской исторической литературе тех лет и стала основанием для назначения его первым преподавателем вновь учрежденной кафедры церковной и гражданской русской истории[990]. Выпускное сочинение его однокурсника иеромонаха Михаила (Монастырева) по Посланию святого апостола Павла к Колоссянам даже изменило его положение в разрядном списке: по списку, составленному Конференцией КДА, он стоял третьим, а митрополит Московский Филарет (Дроздов), читавший от Синода его диссертацию, отозвался с высокой похвалой об этой работе и «указал автору первое место»[991]. Василий Нечаев, окончивший в 1848 г. МДА, представил магистерское сочинение «Святой Дмитрий, митрополит Ростовский», написанное на тему, предложенную профессором А. В. Горским. Сочинение строилось на анализе трудов святителя, изучении исторических документов, исследовании традиции, положенной святителем в русской церковной литературе[992]. Магистр СПбДА 1855 г. Михаил Коялович опубликовал свою диссертацию «Литовская церковная уния» через несколько лет после окончания курса, и она стала столь заметным явлением в церковно-исторической науке, что молодой бакалавр был признан ведущим специалистом в проблемах западнорусской церковной истории[993]. Выпускник МДА 1856 г. иеромонах Хрисанф (Ретивцев) на примере пастырей Церкви IV в. попытался изучить вопрос, особенно актуальный для второй половины 1850‑х гг.: деятельность духовенства по от ношению к общественной жизни[994]. Выпускник той же академии 1860 г. Парфений Репловский представил магистерское сочинение «Иосиф Флавий», вызвавшее интерес не только изложением взглядов самого древнего историка, но и попыткой критической оценки этих взглядов[995]. Окончивший в 1865 г. СПбДА Павел Николаевский после публикации своего магистерского сочинения на тему «Русская проповедь в XV и XVI веках» получил репутацию самостоятельного серьезного исследователя. Разумеется, все эти оценки выпускных работ студентов духовных академий давались с точки зрения современной им науки, поэтому называть их научными исследованиями следует с учетом научного контекста тех лет, уровня развития богословия и науки в целом, самого понятия «исследование». Однако то, что некоторые выпускные сочинения становились серьезным вкладом даже в современную им науку, отчасти свидетельствовало о возможности выпускников заниматься наукой даже в сложных духовно-учебных условиях и открывало перспективы роста в этом направлении. Однако это были отдельные работы, не являющиеся показателем общего научного уровня выпускников, и глобальных проблем, связанных с научной работой в академиях и аттестацией ее результатов, не решали. По-прежнему многие работы, даже увенчанные учеными богословскими степенями, представляли собой то «рассуждения» в духе старинной диалектики, то компиляции трудов иностранных авторов, оправдывавшиеся недоступностью первоисточников.Повышение уровня работ имело и еще одно следствие, печальное для самого учебного процесса: затягивание выпускниками срока подачи сочинений. Если в 1840–50‑х гг. неподача выпускного сочинения в назначенный срок была редким событием, то в 1860–х гг. это стало столь распространенным явлением, что и корпорации академий, и Святейший Синод пытались вырабатывать специальные меры по изменению этой ситуации.