Только три месяца смогла прожить Марина в относительном спокойствии. В конце зимы 1611 года посланцы Семибоярщины уговорили калужан присягнуть королевичу Владиславу. Жить во дворце Лжедмитрия II стало опасно, а бороться с польским королем не было сил. В этой сложной ситуации Марина обратилась за помощью к брату Станиславу, находившемуся в королевском лагере под Смоленском. Но тот лишь смог договориться о том, что на содержание сестры будут предоставлены два города: Гродно и Самбор. Взамен она должна была окончательно отказаться от своих прав на московский трон и царский титул.
Возможно, после трезвого размышления Марина и пошла бы на сделку с королем, но тут выяснилось, что многие городовые воеводы не желают подчиняться полякам и не намерены целовать крест Владиславу. Во главе антипольского движения встал рязанец Прокопий Ляпунов. Поскольку собственного претендента на трон у патриотов не было, то можно было рассчитывать, что им станет малютка Иван. В новой ситуации Марина решила прервать переговоры с Сигизмундом и вместе с Заруцким и казаками покинула ставшую негостеприимной Калугу. Было решено, что донцы вместе со своим атаманом примкнут к Первому ополчению и постараются сделать все возможное, чтобы посадить на престол свою царицу с царевичем Иваном.
Последняя попытка стать государыней
Новым местом пребывания Марины стала подмосковная Коломна. Здесь были достаточно мощный кремль, красивый Успенский собор с богатым внутренним убранством и загородный царский дом-дворец. Со времен Дмитрия Донского русские государи любили приезжать в этот город, живописно раскинувшийся на берегах Оки. Оставив крепкую охрану для своей зазнобы, И. Заруцкий отправился на соединение с П. Ляпуновым. Вместе с ним в ряды ополченцев влились и другие сподвижники второго самозванца во главе со знатным князем Д. Т. Трубецким. На общем собрании воевод было решено двинуться к Москве и попытаться выбить из нее польский гарнизон. В начале апреля состоялись первые бои у стен Белого города. Вскоре вся эта значительная часть столицы оказалась в руках ополченцев. «Седьмочисленные» бояре и их польские союзники были заперты в Кремле и Китай-городе. Но выбить их оттуда сил не хватало.
Летом в подмосковном таборе было избрано временное правительство из трех воевод: Д. Т. Трубецкого, И. М. Заруцкого и П. П. Ляпунова. В триумвирате рязанец занял последнее место, поскольку носил чин только думного дворянина, Трубецкой и Заруцкий считались боярами. Удалой атаман тут же заверил Марину, что в случае победы она вновь станет московской царицей. Он полагал, что слабовольный князь Трубецкой не будет ему перечить, рязанский воевода будет вынужден подчиниться решению большинства.
Однако вскоре оказалось, что Прокопий и другие городовые воеводы даже слышать не желают о Марине и ее сыне, прозванном Воренком. Более того, они начали переговоры с новгородцами о кандидатуре шведского королевича Карла-Филиппа. Все это очень не понравилось Заруцкому, и он решил избавиться от Ляпунова. Натравить буйных казаков на любящего порядок воеводу оказалось очень несложным делом. Помогла и дезинформация о тайных переговорах Прокопия с московскими боярами. Атаманы вызвали рязанца на круг и без разбирательства зарубили саблями.
Марина была очень довольна «подвигами» своего возлюбленного и твердо поверила в то, что вскоре под звон кремлевских колоколов сядет на «свой» престол. Однако выбить поляков из центральных районов Москвы все не удавалось. После смерти Ляпунова все его сторонники, го-, родовые воеводы, покинули подмосковный стан и оставили неуправляемых казаков одних решать сверхсложную задачу. Те же занялись грабежами и разбоем, нагоняя страх на местных жителей. В итоге продовольствие и деньги на содержание ополченцев перестали поступать с мест. Это еще больше ослабило их силы.
Главный инициатор патриотического движения патриарх Гермоген решил вновь обратиться ко всем здоровым силам страны и поднять их на борьбу с польскими интервентами. На этот раз центром сбора ополченцев стал Нижний Новгород. Войско возглавили князь Дмитрий Пожарский и земский староста Кузьма Минин. Иван Заруцкий, узнав, что руководители нового ополчения категорически против воцарения Марины и ее сына, отправил наемных убийц, которые должны были расправиться с Пожарским. Однако те были пойманы и разоблачены.
Летом 1612 года Второе ополчение выступило к Москве. Заруцкий понял, что ему смертельно опасно оставаться в подмосковном лагере: за покушение на убийство князя Дмитрия Михайловича ждала неминуемая расплата. Поэтому, забрав с собой Марину с Иваном, он двинулся в богатые рязанские земли. Гостеприимную Коломну напоследок разграбили и выжгли.