В начале августа 1921 года состоялась вторая общебратская конференция, на которой обсуждались возникшие в процессе деятельности братств новые проблемы, связанные с их положением в богоборческом государстве.
После этой конференции Александро-Невское братство сохранило свой авторитет как самое влиятельное и активное из всех действующих в России. Понимая, что над всеми существовавшими с дореволюционных времен монастырями нависла угроза закрытия, руководители Александро-Невского братства решили приступить к созданию новых монашеских общин за стенами обителей и подготовке к принятию пострига образованных молодых людей обоего пола. В качестве первого шага были созданы женский и мужской кружки по подготовке монашествующих. Уже вскоре были совершены первые постриги мирян из числа членов братства.
К началу 1922 года митрополит Вениамин поочередно возвел отцов Иннокентия и Гурия в сан архимандритов, а 28 февраля 1922 г. отец Иннокентий был хиротонисан во епископа Ладожского.
Деятельность православных братств все более и более расширялась. Был создан фонд помощи неимущим и обездоленным. По благословению митрополита Вениамина, с 12 марта 1922 года отец Лев был назначен заведующим питательным пунктом для голодающих при Александро-Невской Лавре. «Господь да благословит добрым успехом святое начинание», – гласила резолюция Владыки на рапорте наместника Лавры архимандрита Николая (Ярушевича), обратившегося к митрополиту за благословением на открытие пункта.
Воистину богоугодные деяния членов братств вызывали все большее и большее раздражение властей. Так, 26 апреля 1922 года в газете «Известия» говорилось: «В Петрограде свирепствует какая-то эпидемия братств, духовных кружков, подготовительных религиозно-схоластических школ. Духовенство обрабатывает этим путем молодежь».
По всему было видно, что вскоре грядут новые гонения…
Сбылись и на членах братства пророческие слова Спасителя: «
Для вынесения окончательного приговора сотрудникам ГПУ пришлось составлять три обвинительных заключения. В результате «как политически неблагонадежных» епископа Иннокентия и отцов Льва и Гурия выслали из Петрограда на два года.
Тем не менее, благое дело, начатое ими, не угасало – работу Александро-Невского братства возглавил вдохновенный и ревностный иеромонах Варлаам (Сацердотский). Деятельность братства тогда заключалась в следующем: 1) организации церковной строго уставной службы; 2) организации хора; 3) организации занятий по Закону Божию с детьми; 4) организации богослужебного воспитания юношества и собраний, на которых проводилось чтение Евангелий и писаний святых отцов с последующим толкованием. Впоследствии отец Варолаам вспоминал: «Конечной целью членов руководимого мною братства было духовное самоусовершенствование путём полной преданности Церкви. Наиболее религиозно настроенные члены братства организовывали монашеские общежития, целью которых было подготовить себя и жить иноческой жизнью, оставаясь в миру…» В феврале 1924 года иеромонах Варлаам был арестован и приговорен к двум годам концлагеря.
Отец Лев (Егоров) отбывал ссылку в Оренбургской губернии, а затем в Казахстане. В конце 1924 года он вернулся в родной город, носивший к тому времени новое название – Ленинград. До осени 1926 года иеромонах Лев служил периодически, в качестве так называемого «наёмного батюшки», для совершения ранних обеден. В то время ему пришлось подрабатывать, занимаясь переплётным делом.
Владыка Иннокентий, возвратившийся в апреле 1925 года, уже в декабре был вновь арестован и отправлен в ссылку. В город на Неве ему не суждено было вернуться. В дальнейшем он короткое время возглавлял ряд епархий, а в 1937 году был вновь арестован и погиб в заключении.
В июне 1925 года из туркестанской ссылки вернулся в Ленинград архимандрит Гурий (Егоров). Вскоре отец Гурий был назначен настоятелем Киновии Александро-Невской Лавры. В ней продолжали действовать церкви Пресвятой Троицы и Всех Святых. Постепенно архимандрит Гурий сделал Киновию одним из центров братской жизни.
В начале 1926 года вернулся из мест заключения в Ленинград и был возведен в сан архимандрита иеромонах Варлаам (Сацердотский). Он стал служить в Троицкой церкви Творожковского подворья, где его усилиями были сформированы два больших братских хора.