При необычных обстоятельствах иерей Алексий Кибардин оказался одним из приписных священников Феодоровского Государева собора. Община сестер милосердия во имя Христа Спасителя, куда он был определен после окончания Духовной академии, находилась под Августейшим покровительством Государыни Императрицы Александры Феодоровны.
Царственная благодетельница общины неоднократно бывала на богослужениях в храме святой Марии Магдалины на Сергиевской улице, где служил отец Алексий. До самозабвения, умом и сердцем воспаряя к горнему, совершал он священнодействие. Чуткое сердце благочестивейшей Императрицы немедленно оценило нелицемерное усердие молодого священника. 21 июня 1913 года его перевели в Феодоровский Государев собор.
Собор имел особый статус – он был приходом Августейшей Семьи и чинов Собственного Его Императорского Величества Сводного пехотного полка и Собственного Его Величества Конвоя, размещавшихся в Царском Селе. По особым приглашениям на службы в Государев собор допускался только небольшой круг лиц.
В Феодоровском соборе и состоялось знакомство отца Алексия с известным петербургским купцом Василием Николаевичем Муравьевым, входившим в Общество вспомоществования малоимущим ученикам Императорской Царскосельской гимназии, в которой учился его сын – Николай.
В. Н. Муравьев был владельцем двухэтажного особняка в Тярлево неподалеку от Царского Села, являлся одним из наиболее богатых мехоторговцев столицы, имел репутацию щедрого благотворителя и входил в круг наиболее образованной части петербургского купечества.
В списке членов Общества многие известные имена – Константин Иванович и Василий Иванович Рукавишниковы, лейб-медик Евгений Сергеевич Боткин, Евгений Иванович Аренс и другие уважаемые люди своего времени.
Помимо светской элиты в Общество входила и вся духовная элита Царского Села. Состоял в нем и законоучитель гимназии, кандидат богословия, священник Алексий Кибардин. С этим замечательным пастырем будут связаны последние годы земной жизни преподобного Серафима Вырицкого.
С началом Первой Мировой войны при Феодоровском Государевом соборе был открыт лазарет для раненых воинов. Шефство над ним взяли Великие княжны Мария Николаевна и Анастасия Николаевна. Августейшие покровительницы лазарета сами работали здесь в качестве сестер милосердия, помогая медикам и раненым. Операции и перевязки шли круглосуточно. Многие раненые погибали от потери крови, гангрены и других осложнений. К обязанностям полкового священника Императорского Конвоя у отца Алексия прибавилось новое многотрудное послушание – пастырское служение в переполненных ранеными лазаретах.
Священство собора не имело времени для отдыха ни днем, ни ночью: безконечно было число исповедников, многие из которых не знали, доживут ли до следующего дня. Они уповали на Бога больше, чем на врачей. Здесь надо было проявлять необыкновенную чуткость и осторожность, чтобы недугующие не теряли надежды на спасение в этой жизни и в будущей. В соборе непрестанные панихиды чередовались с молебнами о даровании победы российскому воинству, об избавлении от неволи томящихся в плену.
Государыня Императрица и Ее Августейшие Дочери, работая в царскосельских лазаретах, с необычайным состраданием относились к раненым воинам. Так же, терпеливо и безропотно, с присущим ему смирением и любовью, нес свои многотрудные послушания и отец Алексий. Императрица и Великие Княжны почитали искреннее душевное усердие отца Алексия. Во славу Божию трудились все они рука об руку. За годы испытаний возникла и укрепилась их трепетная духовная дружба…
Отец Алексий стал свидетелем начала крестного мученического пути Царской Семьи во время ее пребывания в Царском Селе после ареста. Он видел, с какой кротостью и смирением переносили Царственные Мученики все унижения от взбесившейся разнузданной солдатни. До конца дней своих хранил отец Алексий светлые воспоминания об Августейшей Семье.
С 1922 года отец Алексий Кибардин, возведенный в сан протоиерея будущим священномучеником митрополитом Вениамином, стал настоятелем собора. Его проникновенное служение и светлые проповеди привлекали многих истинно верующих людей не только из Царского Села, но и из Петрограда. С наиболее верными своими духовными чадами батюшка постоянно служил панихиды по невинно убиенной Царской Семье.
В 1927 году, после выхода в свет Декларации митрополита Сергия, положение протоиерея Алексия весьма осложнилось. Благоговейное почитание светлой памяти Царской Семьи было неотъемлемой частью его существования. Поминать богоборческие власти и молиться об их благоденствии, да еще под сводами Государева собора для отца Алексия было равносильно предательству Иуды. Это было выше его сил. Без раздумий вступил он в ряды сторонников митрополита Иосифа (Петровых). Совесть пастыря была чиста перед Господом.