Османская империя, потерпев болезненное, но не смертельное поражение от Тимура при Анкаре (Ангорская битва) в 1402 году, под властью очень способных и энергичных правителей быстро набрала силы. Многие другие тюркские государства Малой Азии были разгромлены или уничтожены в череде сражений, растянувшихся более чем на сотню лет. Завоевание Константинополя в 1453 году исполнило давние честолюбивые планы мусульман и повысило османский престиж как раз в то время, когда силы Тимуридов после убийства Улугбека в 1447 году вошли в стадию упадка. В начале XVI века султаны турок-османов добавили Сирию, Египет и Месопотамию к своим владениям. Сосредоточение такой большой власти в их руках требовало более широкой легитимизации, чем могла дать идеология пограничной войны, которая в прежние времена, даже после падения Константинополя, формировала моральную основу османского государства. На ее место пришла новая идеология, позиционирующая османских султанов как защитников суннитской веры. Она не встретила единогласного одобрения, потому что старый дух, связанный с почитанием имама Али, часто намного превосходящим границы, допускаемые суннитской ортодоксией, все еще был жив. Официальный сдвиг к строгому суннизму во время правления Селима I (1512–1530) впоследствии переместил многих его подданных, оказавшихся перед проблемой выбора, в лагерь шиитов. Значительное число жителей мигрировали в Иран, где шиитская вера стала господствующей, начиная с 1501–1502 годов и далее, благодаря династии тюркского (азербайджанского) происхождения — Сефевидам. Приток из Малой Азии, должно быть, существенно укрепил ряды Сефевидов и, возможно, помогает объяснить, почему ни Селим I, несмотря на победу при Чалдыране в 1514 году, ни его преемники не смогли сделать постоянные завоевания на Иранском плато. Государство Сефевидов имело прочную основу и оказалось способным сопротивляться не только османским армиям, но также узбекам и другим центральноазиатским тюркским завоевателям. Выступив на покорение Хорасана, Мухаммед Шейбани был разгромлен и убит в сражении возле Мерва. Возможно, это произошло 2 декабря 1510 года. Тогда ему было 59 лет.
Победа дала Сефевидам контроль над Хорасаном и временно также над Хорезмом. Однако они даже не пытались завладеть Трансоксианой, что, в случае успеха, сделало бы эту территорию, как это неоднократно бывало раньше, пограничным бастионом Ирана. Имея в виду эту цель, они поддержали уже упомянутого тимуридского принца Бабура, сына шейха Омара, который сначала добился ряда успехов, включая временный захват Самарканда и Бухары, но в 1512 году потерпел поражение к северу от Бухары и отступил в юго-восточном направлении в Кабул. Его присутствие там никоим образом не приветствовали местные жители, поскольку он упорствовал в сотрудничестве с Сефевидами и с шиитскими беженцами от режима Шейбани. В конце концов, и ему, и его людям пришлось покинуть и Кабул. После затяжных военных кампаний он получил блестящую компенсацию на другой земле. Некогда вселявшее страх имя монголов этот культурный принц, считавший себя их наследником, принес в Индию. А в Центральной Азии, если не считать небольшой области Бадахшан, Бабур был последним Тимуридом. Зато в Индии он стал первым Великим Моголом. Он умер в 1530 году.