Пьетро, как всегда, добросовестно исполнил все поручения, но принятые им меры лишь усилили недовольство, которое местная знать и без того испытывала в связи с растущим влиянием Венеции на внутренние дела острова. Вскоре после его отъезда сформировался заговор под началом архиепископа Никосийского. 13 ноября 1473 г., за три часа до рассвета, небольшой отряд (включавший и самого архиепископа) ворвался во дворец в Фамагусте и зарубил камергера и врача королевы у нее на глазах. Затем, после недолгих поисков, заговорщики схватили ее дядю Андреа Корнаро и кузена Марко Бембо; обоих постигла та же участь, а их нагие тела были сброшены в ров под окнами королевы, где их некоторое время спустя съели городские собаки. Наконец, саму Катерину заставили дать согласие на брак незаконнорожденной дочери ее покойного мужа с Альфонсом, бастардом неаполитанского короля Фердинанда, и признать упомянутого короля своим наследником – несмотря на то что Жак оставил королевство самой Катерине, а она уже родила от него законного сына.
Вести о перевороте быстро достигли Венеции, и Мочениго приказали немедленно вернуться на остров. С большинством заговорщиков он разобрался быстро. Лишь нескольким, включая архиепископа, удалось бежать, но остальных схватили; зачинщиков повесили, а прочих причастных бросили в тюрьму. Порядок наследования снова был официально изменен. Между тем венецианский сенат отправил на Кипр двух надежных патрициев; формально они были назначены советниками, но на деле стали править островом от имени Катерины. Лишившись всех рычагов влияния, несчастная королева тем не менее осталась на престоле, но с годами ей становилось все труднее удерживать даже номинальную власть. Ее сын, король Жак III, умер годовалым младенцем, в 1474 г., и с тех пор Катерине приходилось непрерывно противостоять интригам своей золовки Шарлотты, с одной стороны, и молодого Альфонсо Неаполитанского – с другой, не говоря уже о бесконечных заговорах местных аристократов, которые видели в ней не столько королеву, сколько марионетку Венеции. Только благодаря венецианскому покровительству Катерина оставалась в живых, но постепенно стала тяготиться своим зависимым положением не меньше своих подданных. Все сколько-нибудь значимые посты при дворе и в правительстве занимали венецианцы; всеми городами и замками правили венецианские наместники и сенешали. В какой-то момент Катерина и ее отец даже подали жалобу в синьорию, заявив, что ее защитники превратились по сути в тюремщиков: Катерину не выпускали из дворца, отняли у нее слуг, и даже трапезничать ей приходилось в одиночестве, за маленьким деревянным столиком. Ей запрещалась всякая переписка, даже с собственными подданными. Жалоба возымела некоторый эффект, и после 1480 г. в жизнь королевы вернулись некоторые удобства, но к тому времени Катерина уже поняла, что, невзирая на громкое звание Дочери святого Марка, для республики она – не более чем досадная помеха, от которой без колебаний избавятся, как только настанет время.
Венеция терпеливо дожидалась своего часа. С 1426 г. Кипр оставался вассалом султана Египетского и выплачивал ему ежегодную дань в размере 8000 дукатов. Поэтому прямая аннексия острова грозила повлечь за собой дипломатические осложнения, чего республика не могла себе позволить. Но вот наконец в 1487 г. мамлюкский султан послал Катерине предупреждение о том, что османский султан Баязид II готовит против него большую военную кампанию, в ходе которой, вероятно, попытается захватить Кипр. Султан умолял королеву принять все необходимые меры для укрепления обороны, обещая взамен освободить остров от дани на два года. Возможно, именно эти события, открывавшие перспективу для объединения Венеции и Египта против общего врага, подтолкнули синьорию к решительным действиям, а последней соломинкой стало раскрытие очередного заговора, вышедшего на свет летом 1488 г. Заговорщики планировали выдать Катерину замуж за Альфонсо Неаполитанского, по всей вероятности с ведома и согласия самой королевы. Руководитель заговора – некто Риццо ди Марино, который был причастен еще к перевороту 1473 г., но успевший бежать от возмездия, как и его друг архиепископ, – был схвачен, доставлен в Венецию и удушен по приказу Совета десяти, но не следовало сбрасывать со счетов опасность того, что Катерина все же вступит в новый брак. И в октябре 1488 г. Венеция приняла решение официально включить Кипр в состав Венецианской империи, а королеву вернуть на родину, по возможности с почестями, но если понадобится, то силой.