Как ни страшно было нашествие монголов, результаты его были однако же менее бедственны, чем последовавшее, более продолжительное занятие страны Оттоманскими турками. Чтобы избавиться от этих последних и злейших детей Востока, венгерцы выбрали своим королем германского императора. Но они обманулись в своих надеждах: помощь, оказанная им императором, не была ни своевременна, ни действительна. В самом деле, исследования новейших венгерских историков показали, что императорские советники очень далеки были от мысли изгнать турков; напротив, они видели в них своих помощников в деле сломления привязанности надменных мадьяров к их наследственной конституционной свободе.
В 1566 году Венгрия вновь стала полем соперничества между османами и Габсбургами: престарелый султан Сулейман Великолепный предпринял свой последний поход на Венгрию и умер в ночь с 6 на 7 сентября при осаде крепости Сигетвар – прямо в своем великолепном шатре.
В 1570 году Янош Жигмонд и Максимилиан II Габсбург подписали договор в Шпайере, по которому Янош Жигмонд отрекся от венгерской короны, за что был признан Габсбургами князем Трансильвании с сохранением ее в вассальной зависимости от Венгерского королевства.
Эта структура сохранилась и после смерти Яноша Жигмонда, хотя на нем пресеклась династия Запольяи.
Стефан Баторий (Иштван Батори) и его время
Янош Жигмонд умер 14 марта 1571 года, и он завещал трон своему казначею Гашпару Бекешу. Однако аристократия не признала это решение и выбрала Стефана Батория (Иштвана Батори), будущего короля польского и великого князя литовского. Это привело к короткой гражданской войне, которая закончилась победой Батория (в 1575 году войска Гашпара Бекеша были окончательно разбиты, а его земли конфискованы).
В Венгрии горячие противники протестантства погибли в битве при Мохаче; после нее наступило анархическое состояние; не было власти, достаточно сильной для преследования еретиков. Венгры, учившиеся в Виттенберге, становились на родине распространителями протестантства <…> В немецких войсках, приходивших в Венгрию сражаться за Фердинанда, было множество лютеран; они также распространяли свою веру между венграми. Многие магнаты приняли протестантство: правда, оба соперника, сражавшиеся за венгерский престол, были враждебны реформации (Фердинанд еще был тогда гонителем ее); но вельможи, почти независимые в своих владениях, не обращали внимания на волю королей. Фердинанд рассудил, что уменьшает в Венгрии число своих приверженцев враждой к протестантам, и прекратил гонение.
Стефан Баторий (Иштван Батори) вошел в историю как король польский и великий князь литовский. Но он был венгром по национальности, знал венгерский и молдавский языки. Положение же дел в Венгрии стало совсем запутанным. Сами венгры выбрали королем и короновали Яноша Запольяи, воеводу Трансильвании. Другая часть венгров выбрала в Пресбурге Фердинанда, что повело к продолжительной борьбе за Венгрию, осложнившейся еще и вмешательством турок. Потом соединение Венгрии, Чехии, Моравии и Силезии с наследственными габсбургскими землями создало обширную Габсбургскую монархию, которая для Западной Европы являлась прикрытием со стороны турок.