Вирусы. Драйверы эволюции. Друзья или враги?

Особенностью жизненного цикла ретровируса является то, что геном вируса встраивается в хромосому хозяина. Хотя ВИЧ-1 убивает большую часть инфицированных им клеток, некоторые клетки, в особенности Т-клетки иммунологической памяти, могут стать латентно инфицированными. Эти клетки формируют постоянный архив вирусных генотипов, создающийся в самом начале заболевания. Больше того, латентно инфицированные клетки периодически реактивируются и выбрасывают вирусы с генотипом, циркулировавшим ранее. Вполне вероятно, что вирус, переданный другому хозяину и основавший новую вирусную популяцию, наделен архивным вирусным геномом, отобранным благодаря благоприятным признакам. Если это так, то мы получаем объяснение, почему вирус, который передается от инфицированного хозяина новому здоровому хозяину, больше похож на предшествующий первоначальный вирус, чем можно было бы ожидать. Следовательно, несмотря на то что избегание иммунного ответа при персистирующей инфекции критически важно для выживания вирусной линии внутри организма-хозяина (действительно, избежавшие иммунного ответа вирусы часто передаются новым хозяевам), мы должны заключить, что необузданная генетическая вариабельность и оппортунистическая эволюция, которую претерпевает вирус в период далеко зашедшего заболевания, – всего лишь второстепенное явление. Большая часть изменений не является необходимой и даже полезной для выживания генетической линии на уровне популяции и для поддержания цепи передачи. Это эволюция без последствий.

Адаптивная эволюция: развивающиеся отношения