В 1905 году Кёппен оборудовал аэрологическим инструментарием гидрографическое судно «Планета», а в 1906-м – специализированное судно «Чайка»[57]
, команду которых он обучил работе с воздушными змеями и воздушными шарами на своей аэростатной станции. В 1908 году он лично принял участие в пробном рейсе «Чайки» в водах Балтийского моря, однако на протяжении всего плавания так страдал от морской болезни, что мог отдавать распоряжения только лежа, и адмирал Тирпиц высадился вместе с ним на острове Рюген, чтобы положить конец его мучениям. Свою морскую болезнь Кёппен компенсировал многочасовым полетом на воздушном шаре под руководством Р. Зюринга. Полеты Кёппена на море стали началом серии исследований в области морской аэрологии, заниматься которыми продолжили преемник Кёппена А. Вегенер и его коллега Э. Кульбродт, взявшие на вооружение уже усовершенствованные методы метеорологических исследований. В 1922–1928 годах эти исследования стали частью крупного аэрологического проекта Германской морской обсерватории по изучению Атлантического океана. Целью проекта было развитие зарождавшихся тогда трансатлантических перелетов.В 1896 году Международная метеорологическая организация учредила комиссию по изучению верхних слоев атмосферы. Ее председателем стал немецкий профессор Г. Хергессель, а первыми членами из Германии – Кёппен, Ассман и Берсон. В последующие годы Кёппен принимал участие почти во всех проектах и заседаниях этой международной комиссии. На одном из ее заседаний, проходившем в Петербурге в 1904 году, он продемонстрировал новую модель воздушного змея и вынес на обсуждение немало предложений. Своими систематическими измерениями, новыми идеями и фундаментальными публикациями он способствовал развитию новой отрасли – аэрологии.
Аэростатная лаборатория Германской морской обсерватории
Хергессель, который впоследствии стал известен как один из ведущих специалистов в области аэрологии, в 1926 году, размышляя о развитии этой дисциплины, написал:
В эти годы научная деятельность Кёппена была тесно связана с изучением результатов работы аэростатной станции. В 1901 году он писал: